55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0245 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0245  HAD family hydrolase  100 
 
 
231 aa  472  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1892  HAD family hydrolase  49.25 
 
 
210 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.606117  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50.78 
 
 
198 aa  196  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.542403  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2165  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.67 
 
 
196 aa  185  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.15 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.47 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.09 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  28.49 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  29.03 
 
 
196 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2458  HAD family hydrolase  28.02 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.279583 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  28.8 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  28.49 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  28.49 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  28.8 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  28.8 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  28.8 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  28.8 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  28.96 
 
 
198 aa  64.7  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.23 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  27.17 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  26.23 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  27.72 
 
 
199 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  27.72 
 
 
199 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  26.23 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  28.49 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  29.47 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  26.23 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  26.23 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  26.23 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.42 
 
 
208 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.44 
 
 
217 aa  62.4  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.53 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  27.57 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  25.68 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  25.41 
 
 
231 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  25.27 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  19.62 
 
 
216 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0002  HAD family hydrolase  21.05 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142779  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  24.32 
 
 
196 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  19.35 
 
 
204 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  20 
 
 
198 aa  48.5  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4154  phosphatase  29.03 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3093  hypothetical protein  29.1 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  26.04 
 
 
203 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  46.3 
 
 
206 aa  46.2  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  22.22 
 
 
203 aa  46.2  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1742  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.25 
 
 
204 aa  45.8  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0641396  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  31.09 
 
 
210 aa  45.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  28.64 
 
 
211 aa  45.4  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7538  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  26.01 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.763652 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0572  HAD family hydrolase  33.98 
 
 
207 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112395  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0053  HAD family hydrolase  24.5 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  21.93 
 
 
203 aa  43.5  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0979  HAD-superfamily hydrolase  27.92 
 
 
204 aa  41.6  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>