114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1182 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1182  HAD family hydrolase  100 
 
 
207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142459  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1292  HAD family hydrolase  91.79 
 
 
207 aa  377  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.68 
 
 
291 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.2 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.14 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17550  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  28.71 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0434357  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  40.2 
 
 
228 aa  63.2  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2325  HAD family hydrolase  29.84 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3961  HAD family hydrolase  34.06 
 
 
243 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.29 
 
 
206 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.04 
 
 
298 aa  53.9  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.63 
 
 
227 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.86 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.51 
 
 
237 aa  53.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4524  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.68 
 
 
203 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655556  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.37 
 
 
205 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.37 
 
 
203 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  29.84 
 
 
217 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1787  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.36 
 
 
218 aa  52  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.170193 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_7222  predicted protein  34.95 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.74166  normal  0.591423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.67 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  31.07 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  33 
 
 
292 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  35.05 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24 
 
 
230 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08650  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  40.86 
 
 
261 aa  49.3  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.56 
 
 
188 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  26.85 
 
 
212 aa  48.9  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.16 
 
 
195 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  31.93 
 
 
242 aa  48.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  26.56 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2660  HAD family hydrolase  34.83 
 
 
224 aa  47.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.72425  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  26.56 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  27.08 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  26.56 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  27.08 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  27.08 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  26.56 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.11 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  27.1 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.92 
 
 
224 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  27.1 
 
 
231 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  27.1 
 
 
230 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1023  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.26 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  25 
 
 
203 aa  45.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1146  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.11 
 
 
210 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.1 
 
 
203 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  28.81 
 
 
246 aa  45.4  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3215  HAD superfamily hydrolase  27.91 
 
 
216 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  27.6 
 
 
187 aa  45.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  26.5 
 
 
226 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0839  HAD family hydrolase  30.23 
 
 
219 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.18437  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0426  HAD family sugar phosphatase  27.47 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0044369  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  21.65 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.85 
 
 
219 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4614  HAD family hydrolase  29.29 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  29.47 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0945  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.1 
 
 
233 aa  44.3  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  27.86 
 
 
224 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.78 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 
230 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0853  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.46 
 
 
254 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0133  HAD family hydrolase  27.73 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  22.65 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4647  HAD family phosphatase  30 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  34.18 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  34.18 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  34.18 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  25.23 
 
 
255 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.04 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.02 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0394  HAD family hydrolase  29.84 
 
 
237 aa  43.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  37.21 
 
 
233 aa  43.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0470  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  27.12 
 
 
219 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  34.18 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.51 
 
 
267 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.29 
 
 
234 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  23.38 
 
 
219 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  35.59 
 
 
243 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  40.3 
 
 
227 aa  42.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  26.32 
 
 
585 aa  42.4  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  23.65 
 
 
223 aa  42.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.53 
 
 
228 aa  42.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.52 
 
 
222 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  30.11 
 
 
219 aa  42.4  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.23 
 
 
211 aa  42.4  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  32 
 
 
219 aa  42.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.27 
 
 
238 aa  42.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  32.58 
 
 
258 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1176  HAD family hydrolase  39 
 
 
337 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00246579  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1967  putative HAD superfamily hydrolase  22.5 
 
 
234 aa  42.4  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0600927  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.35 
 
 
233 aa  42  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0732  HAD family hydrolase  42.03 
 
 
225 aa  42  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.447579  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  26.8 
 
 
231 aa  42  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  20.71 
 
 
206 aa  42  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5409  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.87 
 
 
267 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  22.1 
 
 
214 aa  42  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  29.7 
 
 
211 aa  42  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1570  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.3 
 
 
223 aa  42  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.748306  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>