127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2982 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2982  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 217 aa  440  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0839  HAD family hydrolase  55.09 
 
 		 219 aa  236  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.18437  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68390  putative hydrolase  54.46 
 
 		 221 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.024723  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5917  putative hydrolase  53.74 
 
 		 221 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2930  putative hydrolase  53.02 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0283  HAD family hydrolase  50.23 
 
 		 220 aa  221  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310561 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3751  HAD family hydrolase  50.23 
 
 		 229 aa  220  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.312965  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0392  HAD family hydrolase  51.64 
 
 		 220 aa  219  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339275  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0423  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  45.83 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0274  HAD family hydrolase  50.47 
 
 		 220 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4951  HAD family hydrolase  50 
 
 		 220 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0259  HAD superfamily hydrolase  50 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0284  HAD family hydrolase  50 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05480  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50.96 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100764  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4942  HAD family hydrolase  46.26 
 
 		 220 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5403  HAD-superfamily hydrolase  46.01 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0139  HAD family hydrolase  44.6 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3624  carboxylyase-like protein  43.78 
 
 		 222 aa  203  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.701586 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0151  HAD family hydrolase  47.22 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0397198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.22 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000944364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2986  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.76 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28871e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1891  hydrolase  47.44 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000708914  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2660  HAD family hydrolase  46.54 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.72425  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0167  HAD family hydrolase  45.75 
 
 		 220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1723  HAD family hydrolase  47.91 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0177  HAD family hydrolase  44.86 
 
 		 220 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0128  HAD family hydrolase  44.39 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0162  HAD family hydrolase  45.75 
 
 		 220 aa  195  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03970  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  47.29 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.86 
 
 		 220 aa  192  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0369  HAD family hydrolase  46.05 
 
 		 228 aa  191  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243044 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0155  HAD family hydrolase  43.81 
 
 		 222 aa  191  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1694  HAD superfamily hydrolase  47.44 
 
 		 224 aa  191  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1394  HAD family hydrolase  45.54 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3556  HAD family hydrolase  44.29 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2217  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.91 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1570  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.67 
 
 		 223 aa  188  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.748306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0164  HAD family hydrolase  43.93 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1757  HAD family hydrolase  41.4 
 
 		 226 aa  188  7e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1630  haloacid dehalogenase-like hydrolase  45.37 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0222  HAD family hydrolase  44.34 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4195  HAD family hydrolase  43.93 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0160  HAD family hydrolase  43.46 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0182  HAD family hydrolase  42.99 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3812  HAD family hydrolase  40.47 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4347  HAD family hydrolase  42.38 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.743736  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4614  HAD family hydrolase  38.81 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.53 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3768  HAD hydrolase, IA family  40 
 
 		 222 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3802  HAD hydrolase, IA family  40 
 
 		 222 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0323817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3693  HAD hydrolase, IA family  40 
 
 		 222 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3695  HAD hydrolase, IA family  40 
 
 		 222 aa  177  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3865  HAD hydrolase, IA family  40 
 
 		 222 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.6 
 
 		 238 aa  177  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0116  HAD family hydrolase  41.4 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3975  HAD family hydrolase  40.38 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3736  HAD family hydrolase  40.38 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0177  HAD family hydrolase  40.38 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3777  HAD hydrolase, IA family  39.07 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03251  predicted hydrolase  39.07 
 
 		 222 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0314  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.07 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03203  hypothetical protein  39.07 
 
 		 222 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0329  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.43 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3595  HAD family hydrolase  39.07 
 
 		 222 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3871  HAD family hydrolase  39.07 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0314  HAD family hydrolase  39.07 
 
 		 222 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.104507 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3677  HAD family hydrolase  39.07 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.413497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4704  HAD hydrolase, IA family  39.07 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4719  HAD family hydrolase  41.43 
 
 		 221 aa  174  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.43 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2420  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.18 
 
 		 227 aa  164  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0156  hydrolase  34.38 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0628  HAD family hydrolase  30.1 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1146  HAD family hydrolase  30.5 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.479676  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.19 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.32 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2691  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  44.07 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.76 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  23.77 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.27 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  28.49 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.56 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4524  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655556  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.39 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.94 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  22.46 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.84 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  25 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  22 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  31.63 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.13 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  23.64 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  28.93 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  28.93 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  27.89 
 
 		 227 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25 
 
 		 232 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  28.02 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0673  HAD family hydrolase  25.64 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.13 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121216 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>