111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0423 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0423  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  100 
 
 		 230 aa  472  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0139  HAD family hydrolase  57.41 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0151  HAD family hydrolase  56.81 
 
 		 223 aa  249  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0397198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05480  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50.23 
 
 		 221 aa  238  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100764  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03970  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  56.1 
 
 		 222 aa  235  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0839  HAD family hydrolase  52.61 
 
 		 219 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.18437  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5403  HAD-superfamily hydrolase  48.64 
 
 		 220 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0283  HAD family hydrolase  50.23 
 
 		 220 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310561 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4942  HAD family hydrolase  48.18 
 
 		 220 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0259  HAD superfamily hydrolase  49.09 
 
 		 220 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0274  HAD family hydrolase  49.09 
 
 		 220 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68390  putative hydrolase  52.15 
 
 		 221 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.024723  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0284  HAD family hydrolase  49.09 
 
 		 220 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4951  HAD family hydrolase  48.64 
 
 		 220 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3624  carboxylyase-like protein  48.64 
 
 		 222 aa  228  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.701586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0392  HAD family hydrolase  50.23 
 
 		 220 aa  228  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5917  putative hydrolase  51.67 
 
 		 221 aa  228  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4614  HAD family hydrolase  45.5 
 
 		 225 aa  218  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2982  HAD superfamily hydrolase  45.83 
 
 		 217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0160  HAD family hydrolase  49.32 
 
 		 220 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4195  HAD family hydrolase  48.86 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0164  HAD family hydrolase  48.86 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1757  HAD family hydrolase  46.67 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3556  HAD family hydrolase  47.14 
 
 		 233 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0162  HAD family hydrolase  47.25 
 
 		 220 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0167  HAD family hydrolase  47.25 
 
 		 220 aa  208  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.79 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.19 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2930  putative hydrolase  45.02 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.5 
 
 		 234 aa  204  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0177  HAD family hydrolase  45.87 
 
 		 220 aa  204  9e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2660  HAD family hydrolase  47.22 
 
 		 224 aa  202  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.72425  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.76 
 
 		 238 aa  201  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0329  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.96 
 
 		 225 aa  201  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0155  HAD family hydrolase  45.41 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3751  HAD family hydrolase  43.42 
 
 		 229 aa  198  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.312965  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4719  HAD family hydrolase  47.12 
 
 		 221 aa  198  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0182  HAD family hydrolase  46.45 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4347  HAD family hydrolase  45.19 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.743736  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0222  HAD family hydrolase  46.48 
 
 		 224 aa  194  9e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3975  HAD family hydrolase  44.7 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3736  HAD family hydrolase  44.7 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0177  HAD family hydrolase  44.7 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03251  predicted hydrolase  43.58 
 
 		 222 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3595  HAD family hydrolase  43.58 
 
 		 222 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0314  HAD family hydrolase  43.58 
 
 		 222 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.104507 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03203  hypothetical protein  43.58 
 
 		 222 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0314  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.12 
 
 		 222 aa  189  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3871  HAD family hydrolase  43.12 
 
 		 222 aa  189  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3677  HAD family hydrolase  43.12 
 
 		 222 aa  189  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.413497 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3777  HAD hydrolase, IA family  43.12 
 
 		 222 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4704  HAD hydrolase, IA family  43.12 
 
 		 222 aa  189  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3812  HAD family hydrolase  43.12 
 
 		 227 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0116  HAD family hydrolase  44.91 
 
 		 221 aa  188  7e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3768  HAD hydrolase, IA family  42.86 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3802  HAD hydrolase, IA family  42.86 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0323817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3693  HAD hydrolase, IA family  42.86 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3695  HAD hydrolase, IA family  42.86 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3865  HAD hydrolase, IA family  42.86 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0156  hydrolase  41 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0128  HAD family hydrolase  42.4 
 
 		 224 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1394  HAD family hydrolase  42.92 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0369  HAD family hydrolase  42.65 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243044 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1694  HAD superfamily hydrolase  43.33 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2986  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.46 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28871e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1891  hydrolase  41.31 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000708914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.46 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000944364  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1630  haloacid dehalogenase-like hydrolase  41.88 
 
 		 228 aa  167  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2217  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.5 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1570  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.24 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.748306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1723  HAD family hydrolase  37.73 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2420  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1146  HAD family hydrolase  24.87 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.479676  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0628  HAD family hydrolase  28.06 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0350  HAD family hydrolase  25.12 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.373549  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  26.61 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3177  phosphoglycolate phosphatase  25.54 
 
 		 246 aa  49.3  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0670  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.41 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.294369 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  29.57 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.19 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.34 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00251058  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  25.4 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  21.89 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0673  HAD family hydrolase  29.31 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  24.11 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5456  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.27 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  0.179199 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  23.42 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  24.11 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  25 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  23.63 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  25 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  25 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  25 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  25 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  25 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  25 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.36 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  25 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  25 
 
 		 199 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>