123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0514 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0514  phosphonoacetaldehyde hydrolase  100 
 
 
280 aa  560  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0295748 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2896  phosphonoacetaldehyde hydrolase  50.9 
 
 
277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0103695 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1731  phosphonoacetaldehyde hydrolase  51.99 
 
 
277 aa  291  6e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.0777557 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0966  phosphonoacetaldehyde hydrolase  48.73 
 
 
283 aa  269  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12889 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1480  phosphonoacetaldehyde hydrolase  46.69 
 
 
264 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1439  phosphonoacetaldehyde hydrolase  45.14 
 
 
267 aa  260  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3967  phosphonoacetaldehyde hydrolase  44.36 
 
 
264 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1239  phosphonoacetaldehyde hydrolase  45.14 
 
 
264 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1215  phosphonoacetaldehyde hydrolase  45.14 
 
 
264 aa  260  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1217  phosphonoacetaldehyde hydrolase  45.14 
 
 
264 aa  260  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1340  phosphonoacetaldehyde hydrolase  45.14 
 
 
264 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1240  phosphonoacetaldehyde hydrolase  44.75 
 
 
264 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1377  phosphonoacetaldehyde hydrolase  44.36 
 
 
264 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1051  phosphonoacetaldehyde hydrolase  45.53 
 
 
264 aa  258  7e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1414  phosphonoacetaldehyde hydrolase  44.75 
 
 
264 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3836  phosphonoacetaldehyde hydrolase  44.81 
 
 
277 aa  248  8e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3421  phosphonoacetaldehyde hydrolase  36.36 
 
 
274 aa  228  7e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2989  phosphonoacetaldehyde hydrolase  47.35 
 
 
270 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2117  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.8 
 
 
267 aa  225  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2141  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.42 
 
 
267 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3261  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.67 
 
 
275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258798  normal  0.0791037 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0548  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.41 
 
 
271 aa  211  7.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000564985  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3627  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.39 
 
 
269 aa  211  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47280  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.63 
 
 
275 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2412  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.47 
 
 
281 aa  205  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3684  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.37 
 
 
275 aa  205  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4080  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.63 
 
 
275 aa  204  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0814  phosphonoacetaldehyde hydrolase  37.55 
 
 
271 aa  202  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180019  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2749  phosphonoacetaldehyde hydrolase  36.43 
 
 
295 aa  199  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2208  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.52 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136428  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3530  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.52 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359748  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000769  phosphonoacetaldehyde hydrolase  37.92 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04874  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.29 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1833  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.52 
 
 
275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3462  phosphonoacetaldehyde hydrolase  37.78 
 
 
275 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4474  phosphonoacetaldehyde hydrolase  37.88 
 
 
292 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.139325 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4608  phosphonoacetaldehyde hydrolase  37.88 
 
 
292 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363137  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0473  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.73 
 
 
269 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0479  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.73 
 
 
269 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.34346  normal  0.293244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0534  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.73 
 
 
269 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0492  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.73 
 
 
269 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0471  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.73 
 
 
269 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2313  phosphonoacetaldehyde hydrolase  37.15 
 
 
257 aa  183  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.546562  normal  0.912396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3095  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.06 
 
 
234 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0156733  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.25 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2007  HAD family hydrolase  26.25 
 
 
233 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0418734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2632  HAD family hydrolase  25.87 
 
 
233 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503423  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2114  hypothetical protein  27.65 
 
 
196 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0053  hydrolase  26.44 
 
 
229 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1909  hypothetical protein  27.87 
 
 
202 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.363123  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3402  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.06 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0865244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1319  HAD family hydrolase  27.24 
 
 
223 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  33.04 
 
 
224 aa  53.1  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.47 
 
 
220 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0176298  hitchhiker  0.0000825577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  28.94 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.37 
 
 
219 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03670  predicted phosphatase  31.58 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0282294  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  26.57 
 
 
223 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  25.49 
 
 
221 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.88 
 
 
231 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1715  HAD family hydrolase  47.54 
 
 
195 aa  50.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.101498 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.74 
 
 
231 aa  50.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27890  hypothetical protein  27.68 
 
 
247 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0581  HAD family hydrolase  27.93 
 
 
207 aa  49.7  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.696178  normal  0.657435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  25.11 
 
 
225 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1301  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.11 
 
 
228 aa  49.3  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  25.98 
 
 
215 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2354  hypothetical protein  26.76 
 
 
247 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  28.36 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  25.11 
 
 
225 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.14 
 
 
218 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  35.42 
 
 
214 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.43 
 
 
230 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0071  phosphatase-like protein  25.4 
 
 
246 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3851  hypothetical protein  28.57 
 
 
206 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.911623 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.71 
 
 
233 aa  46.6  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  29.8 
 
 
229 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  31.33 
 
 
225 aa  46.2  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1925  phosphatase/phosphohexomutase-like protein  24.77 
 
 
239 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0027  HAD-superfamily hydrolase  23.69 
 
 
238 aa  45.8  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.57 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  29.8 
 
 
229 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  26.61 
 
 
229 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.24 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0325282  hitchhiker  0.00357212 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  31.03 
 
 
215 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  28 
 
 
252 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  24.78 
 
 
252 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  28 
 
 
252 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.12 
 
 
249 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  29.29 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  25.7 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  23.91 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  27.11 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  24.78 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  29.24 
 
 
227 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  26.26 
 
 
226 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  32.54 
 
 
231 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  32.28 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  30.43 
 
 
252 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  25.55 
 
 
225 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>