146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4474 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4608  phosphonoacetaldehyde hydrolase  100 
 
 		 292 aa  591  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4474  phosphonoacetaldehyde hydrolase  100 
 
 		 292 aa  591  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.139325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2208  phosphonoacetaldehyde hydrolase  70.22 
 
 		 275 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3530  phosphonoacetaldehyde hydrolase  70.22 
 
 		 275 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3462  phosphonoacetaldehyde hydrolase  70.59 
 
 		 275 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3684  phosphonoacetaldehyde hydrolase  69.63 
 
 		 275 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1833  phosphonoacetaldehyde hydrolase  69.85 
 
 		 275 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47280  phosphonoacetaldehyde hydrolase  70 
 
 		 275 aa  384  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4080  phosphonoacetaldehyde hydrolase  70 
 
 		 275 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3261  phosphonoacetaldehyde hydrolase  68.89 
 
 		 275 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258798  normal  0.0791037 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000769  phosphonoacetaldehyde hydrolase  52.73 
 
 		 284 aa  286  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04874  phosphonoacetaldehyde hydrolase  54.14 
 
 		 271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2749  phosphonoacetaldehyde hydrolase  51.13 
 
 		 295 aa  276  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0548  phosphonoacetaldehyde hydrolase  52.63 
 
 		 271 aa  272  5.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000564985  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0814  phosphonoacetaldehyde hydrolase  51.13 
 
 		 271 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180019  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0471  phosphonoacetaldehyde hydrolase  54.68 
 
 		 269 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2412  phosphonoacetaldehyde hydrolase  54.14 
 
 		 281 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0479  phosphonoacetaldehyde hydrolase  53.93 
 
 		 269 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.34346  normal  0.293244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0534  phosphonoacetaldehyde hydrolase  53.93 
 
 		 269 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0492  phosphonoacetaldehyde hydrolase  53.93 
 
 		 269 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0473  phosphonoacetaldehyde hydrolase  53.56 
 
 		 269 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2117  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.4 
 
 		 267 aa  218  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2141  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.26 
 
 		 267 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2896  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.24 
 
 		 277 aa  218  8.999999999999998e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0103695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0966  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.15 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.12889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1731  phosphonoacetaldehyde hydrolase  37.23 
 
 		 277 aa  198  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.0777557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3836  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.69 
 
 		 277 aa  198  9e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3421  phosphonoacetaldehyde hydrolase  33.71 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3627  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.26 
 
 		 269 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3967  phosphonoacetaldehyde hydrolase  35.91 
 
 		 264 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1439  phosphonoacetaldehyde hydrolase  36.29 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1414  phosphonoacetaldehyde hydrolase  36.29 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1239  phosphonoacetaldehyde hydrolase  36.29 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1215  phosphonoacetaldehyde hydrolase  36.29 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1217  phosphonoacetaldehyde hydrolase  36.29 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1340  phosphonoacetaldehyde hydrolase  36.29 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1377  phosphonoacetaldehyde hydrolase  35.52 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0514  phosphonoacetaldehyde hydrolase  37.88 
 
 		 280 aa  191  9e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0295748 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1240  phosphonoacetaldehyde hydrolase  35.52 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1051  phosphonoacetaldehyde hydrolase  35.91 
 
 		 264 aa  188  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2989  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.98 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1480  phosphonoacetaldehyde hydrolase  35.52 
 
 		 264 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2313  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.89 
 
 		 257 aa  176  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.546562  normal  0.912396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3851  hypothetical protein  27.49 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2114  hypothetical protein  27.22 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3095  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.78 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0156733  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1909  hypothetical protein  27.22 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.363123  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1319  HAD family hydrolase  25.59 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3402  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.63 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0865244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.35 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0176298  hitchhiker  0.0000825577 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1301  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.19 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.65 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2632  HAD family hydrolase  30.95 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27890  hypothetical protein  29.55 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0027  HAD-superfamily hydrolase  27.91 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  28.22 
 
 		 735 aa  56.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2007  HAD family hydrolase  26.96 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0418734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1717  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.98 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  26.97 
 
 		 221 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  25.74 
 
 		 227 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.74 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  28.48 
 
 		 229 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 238 aa  52.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0714  hydrolase  33.65 
 
 		 255 aa  52.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1925  phosphatase/phosphohexomutase-like protein  27.19 
 
 		 239 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27121 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1697  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.26 
 
 		 221 aa  52.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.26 
 
 		 221 aa  52.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.417032  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  26.32 
 
 		 218 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2354  hypothetical protein  31.86 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  27.19 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0071  phosphatase-like protein  26.42 
 
 		 246 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03670  predicted phosphatase  29.2 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0282294  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0437  2-deoxyglucose-6-phosphatase  21.57 
 
 		 221 aa  50.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000756317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  28.48 
 
 		 228 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2582  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  24.64 
 
 		 224 aa  49.3  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1451  HAD superfamily hydrolase  24.29 
 
 		 241 aa  49.3  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25 
 
 		 217 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  25.62 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  26.03 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1419  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.13 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  hitchhiker  0.00259415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2022  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.13 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.5 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.02 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  27.81 
 
 		 229 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.13 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0029739  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.13 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.905236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1451  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.13 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.913842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  25.84 
 
 		 229 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  26.79 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  25.45 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1947  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.3 
 
 		 222 aa  47  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2445  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.3 
 
 		 222 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1464  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.3 
 
 		 222 aa  47  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0284  2-deoxyglucose-6-phosphatase  22.12 
 
 		 221 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458991 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1972  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.3 
 
 		 222 aa  47  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1912  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23 
 
 		 223 aa  47  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01696  predicted hydrolase  23.3 
 
 		 222 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  30.36 
 
 		 242 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01684  hypothetical protein  23.3 
 
 		 222 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1905  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.3 
 
 		 222 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.798501  normal  0.727123 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>