More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0934 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0934  HAD family hydrolase  100 
 
 
214 aa  441  1e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1246  HAD superfamily hydrolase  37.44 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1683  HAD family hydrolase  35.23 
 
 
231 aa  115  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0673  HAD family hydrolase  35.64 
 
 
211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0332  HAD family hydrolase  36.63 
 
 
210 aa  103  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
461 aa  81.3  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  26.89 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  29.03 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  29.19 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  28.28 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  27.75 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.23 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.21 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0912057  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  27.72 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  27.49 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  26.46 
 
 
237 aa  72  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  26.67 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  25.84 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0996  phosphoglycolate phosphatase  31.21 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137981  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3103  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
562 aa  69.7  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.43 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  27.62 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  27.73 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  27.27 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0558  phosphoglycolate phosphatase  30.64 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1037  phosphoglycolate phosphatase  30.64 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  27.72 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2304  HAD family hydrolase  28.87 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652895  hitchhiker  0.000448515 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  25.88 
 
 
238 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  26.17 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  26.46 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  26.15 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0917  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0326596 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  28.11 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  25.36 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  26.77 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.37 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  28.73 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0913  phosphoglycolate phosphatase  29.65 
 
 
238 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4150  2-phosphoglycolate phosphatase  29.48 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  28.42 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  28.22 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  28.34 
 
 
225 aa  63.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  27.72 
 
 
237 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  24.75 
 
 
272 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.55 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.090781  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1729  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 
213 aa  63.2  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.970974  hitchhiker  0.00217318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  24.24 
 
 
272 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  27.93 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  27.03 
 
 
222 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  26.15 
 
 
214 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  25.94 
 
 
227 aa  62.4  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  25.41 
 
 
223 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  25.85 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  25.41 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  27.6 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.27 
 
 
254 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  25.87 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  25.26 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  27.37 
 
 
221 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  27.96 
 
 
226 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 
223 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  24.15 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  30.26 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  24.74 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  26.46 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  30.32 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  27.09 
 
 
228 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.6 
 
 
232 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.998223  normal  0.137923 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.51 
 
 
219 aa  59.7  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2305  HAD family hydrolase  25.68 
 
 
234 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000065885 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  24.29 
 
 
218 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  23 
 
 
272 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  23 
 
 
272 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2132  HAD family hydrolase  24.86 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  23.04 
 
 
227 aa  59.3  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  27.07 
 
 
223 aa  58.9  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  27.6 
 
 
224 aa  58.9  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  26.26 
 
 
223 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.43 
 
 
216 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  25.67 
 
 
226 aa  58.5  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  26.49 
 
 
225 aa  58.5  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  22.96 
 
 
272 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  26.78 
 
 
219 aa  58.5  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  26.83 
 
 
228 aa  58.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  25.38 
 
 
212 aa  58.5  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.82 
 
 
216 aa  58.2  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  25.77 
 
 
229 aa  58.2  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.93 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.7 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  27.22 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1462  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.56 
 
 
330 aa  58.2  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  26.15 
 
 
233 aa  57.4  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  26.6 
 
 
251 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  25.99 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1970  HAD family hydrolase  25.4 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000840588  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>