More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3036 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_3036  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
224 aa  460  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  31.1 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  29.47 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  29.41 
 
 
216 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  32.06 
 
 
210 aa  91.7  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  30.69 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  28.43 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  28.43 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  28.43 
 
 
216 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  28.43 
 
 
216 aa  90.1  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  28.43 
 
 
216 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.89 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  28.92 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  28.43 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  27.94 
 
 
216 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  25.94 
 
 
225 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
272 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  27.78 
 
 
214 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.94 
 
 
225 aa  85.1  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  26.64 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  28.36 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  31.34 
 
 
217 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  25.12 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  26.2 
 
 
272 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  26.2 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  28.08 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  26.92 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  27.44 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  27.91 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  27.19 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  26.05 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  26.05 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  28.37 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  24.41 
 
 
272 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  28.42 
 
 
214 aa  74.7  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  24.41 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  27.49 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  28.02 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  27.85 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  30.58 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.8 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  27.85 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  27.85 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  27.03 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  25.46 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.64 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  31.03 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  25.23 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  29.47 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  25.68 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  26.39 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  25.56 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  27.85 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  25.58 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  28.11 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.05 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  27.36 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  23.26 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  25.23 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  28.9 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  25.7 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.47 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  26.42 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  24.88 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  28.57 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0919  HAD family hydrolase  27.84 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000975491  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  24.64 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  25.94 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0218  HAD superfamily hydrolase  27.14 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  28.23 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  24.41 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  27.57 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  27.91 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  25.24 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  27.04 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  25.24 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  25.24 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  26.79 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  26.79 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  26.44 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  24.39 
 
 
233 aa  64.3  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  24.49 
 
 
223 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  24.15 
 
 
238 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  25.56 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  25.37 
 
 
226 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  25.56 
 
 
238 aa  63.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  27.36 
 
 
256 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  24.52 
 
 
238 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  26.07 
 
 
236 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  26.89 
 
 
254 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0718  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.44 
 
 
221 aa  63.5  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000286264  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>