More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0767 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  100 
 
 
220 aa  443  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  46.7 
 
 
219 aa  198  7e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  47.12 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  48.57 
 
 
219 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  46.63 
 
 
219 aa  193  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  46.63 
 
 
219 aa  193  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  46.63 
 
 
219 aa  193  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01294  predicted beta-phosphoglucomutase  46.15 
 
 
219 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01305  hypothetical protein  46.15 
 
 
219 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  50 
 
 
215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  45.89 
 
 
219 aa  184  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  49.07 
 
 
214 aa  181  8.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  45.32 
 
 
216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0997  HAD family sugar phosphatase  45.41 
 
 
223 aa  179  4e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  47.14 
 
 
219 aa  178  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  42.99 
 
 
585 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  45.33 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  45.79 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  43.46 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0055  beta-phosphoglucomutase  43.98 
 
 
220 aa  171  6.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000775406  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0217  HAD family sugar phosphatase  47.32 
 
 
220 aa  169  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000425935  hitchhiker  0.000000624715 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  47.85 
 
 
223 aa  169  4e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  43 
 
 
207 aa  168  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  41.4 
 
 
219 aa  168  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  42.65 
 
 
221 aa  167  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  46.81 
 
 
227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  47.4 
 
 
219 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  40.95 
 
 
221 aa  155  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  39.71 
 
 
233 aa  154  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  38.6 
 
 
218 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  41.04 
 
 
965 aa  149  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  40.67 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  38.65 
 
 
978 aa  145  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  42.78 
 
 
216 aa  144  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  37.68 
 
 
986 aa  142  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  41.88 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  39.57 
 
 
230 aa  136  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  35.86 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3311  beta-phosphoglucomutase  39.77 
 
 
220 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.02 
 
 
223 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  32.41 
 
 
456 aa  99.4  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.16 
 
 
220 aa  98.2  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  31.94 
 
 
456 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.83 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  32.57 
 
 
456 aa  95.9  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.53 
 
 
218 aa  95.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.63 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.33 
 
 
1053 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.41 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.47 
 
 
228 aa  90.9  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2868  HAD family hydrolase  31.22 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.68 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.06 
 
 
250 aa  89.4  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.64 
 
 
233 aa  88.6  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.77 
 
 
232 aa  88.2  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.26 
 
 
243 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.83 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.51 
 
 
1055 aa  87  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.14 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.24 
 
 
233 aa  86.3  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  28.89 
 
 
219 aa  86.3  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.7 
 
 
218 aa  86.3  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.44 
 
 
1125 aa  86.3  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.16 
 
 
227 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.23 
 
 
200 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  30.33 
 
 
241 aa  85.5  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  31.22 
 
 
227 aa  85.1  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.9 
 
 
227 aa  84  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.5 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.63 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  31.72 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.39 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.51 
 
 
1314 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.77 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  26.9 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  26.9 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.77 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  26.9 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.3 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.65 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  28.31 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.54 
 
 
1051 aa  82.4  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  31.96 
 
 
242 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  28.27 
 
 
188 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  28.27 
 
 
188 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  28.27 
 
 
188 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  28.7 
 
 
218 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.32 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.34 
 
 
263 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2733  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  29.11 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.53567  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  28.57 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  28.88 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.71 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.34 
 
 
1051 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.47 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.76 
 
 
1053 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.56 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.14 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  29.15 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.06 
 
 
525 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>