More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1014 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  100 
 
 
313 aa  624  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  54.73 
 
 
1055 aa  268  8.999999999999999e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  53.5 
 
 
1053 aa  267  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.67 
 
 
1052 aa  265  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.26 
 
 
1051 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  53.53 
 
 
1053 aa  261  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.24 
 
 
1051 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.85 
 
 
525 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.88 
 
 
1050 aa  245  6.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  51.26 
 
 
1314 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.1 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3420  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.21 
 
 
252 aa  212  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  46.42 
 
 
263 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.42 
 
 
263 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  48.54 
 
 
253 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.04 
 
 
263 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.05 
 
 
262 aa  209  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  46.28 
 
 
262 aa  205  8e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  45.23 
 
 
1088 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.57 
 
 
249 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.72 
 
 
244 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0524  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.12 
 
 
251 aa  202  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0185005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.8 
 
 
254 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09390  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50 
 
 
248 aa  202  6e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2886  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.64 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.03 
 
 
244 aa  195  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.95 
 
 
238 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.86 
 
 
268 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.21 
 
 
1053 aa  192  9e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  44.92 
 
 
260 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.03 
 
 
252 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2717  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.95 
 
 
243 aa  186  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.16 
 
 
246 aa  186  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.02 
 
 
258 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.02 
 
 
246 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.16 
 
 
257 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.73 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.43 
 
 
1125 aa  173  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1473  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.9 
 
 
252 aa  172  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.302617  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.46 
 
 
243 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.02 
 
 
250 aa  168  9e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  42.15 
 
 
240 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  37.95 
 
 
1327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.33 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  35.8 
 
 
219 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  30.29 
 
 
214 aa  103  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  32.54 
 
 
218 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4795  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.18 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  34.29 
 
 
242 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.65 
 
 
242 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  30.33 
 
 
219 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  31.73 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.4 
 
 
242 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  34.11 
 
 
219 aa  93.2  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  30.43 
 
 
221 aa  92.4  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  30.29 
 
 
456 aa  92  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.97 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  30.8 
 
 
215 aa  92  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  30.71 
 
 
456 aa  92  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  31.1 
 
 
207 aa  91.3  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  29.05 
 
 
456 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  28.27 
 
 
216 aa  87  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  30.08 
 
 
216 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  31.03 
 
 
233 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2868  HAD family hydrolase  31.56 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.69 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  28.33 
 
 
227 aa  84  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  26.36 
 
 
221 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.73 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.63 
 
 
218 aa  79  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  26.59 
 
 
220 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  30.54 
 
 
219 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  27.24 
 
 
221 aa  77  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  30.54 
 
 
219 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  28.57 
 
 
208 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  30.54 
 
 
219 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  30.54 
 
 
219 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  30.54 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  29.6 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  30.54 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.86 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  27.23 
 
 
230 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  30.26 
 
 
978 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  30.04 
 
 
219 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.8 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  26.7 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  29.8 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01294  predicted beta-phosphoglucomutase  30.05 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01305  hypothetical protein  30.05 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.24 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.91 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  29.08 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  29.58 
 
 
585 aa  72.8  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  26.61 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.47 
 
 
231 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3311  beta-phosphoglucomutase  28.65 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35659  predicted protein  27.88 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  28.34 
 
 
986 aa  69.3  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  26.89 
 
 
965 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  29.58 
 
 
236 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>