35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1578 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1578  hydrolase  100 
 
 
202 aa  413  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000487041 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1452  hydrolase  55.61 
 
 
203 aa  234  7e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1015  hydrolase  50 
 
 
203 aa  234  7e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.772817  hitchhiker  0.000000000927289 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1645  hydrolase  50 
 
 
201 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  37.08 
 
 
242 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  37.08 
 
 
242 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  37.08 
 
 
242 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  37.08 
 
 
245 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  37.08 
 
 
245 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  37.08 
 
 
242 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  37.08 
 
 
242 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.97 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.45 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.99 
 
 
235 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0922  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.28 
 
 
219 aa  45.4  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  35.96 
 
 
238 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  34.83 
 
 
238 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0642  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.9 
 
 
206 aa  45.1  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0688411  normal  0.579758 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  38.46 
 
 
222 aa  43.9  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  37.96 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.07 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.44 
 
 
217 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.35 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  25.24 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.19 
 
 
235 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.39 
 
 
224 aa  42.4  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0962  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.28 
 
 
230 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.77 
 
 
237 aa  42  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.845236  normal  0.047743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.71 
 
 
230 aa  42  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  33.82 
 
 
233 aa  41.6  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  34.83 
 
 
242 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  27.96 
 
 
223 aa  41.6  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  30.33 
 
 
242 aa  41.2  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  28.69 
 
 
227 aa  41.2  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2928  HAD family hydrolase  26.01 
 
 
230 aa  41.2  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244628  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>