125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1288 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  100 
 
 		 550 aa  1113    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  45.92 
 
 		 541 aa  538  9.999999999999999e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0134  DEAD_2 domain-containing protein  31.36 
 
 		 537 aa  207  3e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117441 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  31.65 
 
 		 537 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  27.33 
 
 		 634 aa  162  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  27.77 
 
 		 574 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  28.06 
 
 		 580 aa  147  6e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  27.39 
 
 		 582 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  24.17 
 
 		 588 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  36.96 
 
 		 575 aa  120  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  24.88 
 
 		 619 aa  105  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  22.85 
 
 		 775 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  22.9 
 
 		 773 aa  91.7  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  22.88 
 
 		 750 aa  90.5  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  22.58 
 
 		 669 aa  90.5  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  22.92 
 
 		 781 aa  90.5  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  22.96 
 
 		 761 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  22.51 
 
 		 712 aa  90.1  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  22.71 
 
 		 722 aa  90.1  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  25.59 
 
 		 617 aa  89  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  20.53 
 
 		 754 aa  87.4  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  23.33 
 
 		 781 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  22.54 
 
 		 799 aa  84.3  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  23.14 
 
 		 723 aa  83.6  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  21.86 
 
 		 758 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  19.97 
 
 		 754 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  21.61 
 
 		 758 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  24.36 
 
 		 790 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  19.9 
 
 		 779 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  21.66 
 
 		 670 aa  77  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  20.46 
 
 		 798 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  21.5 
 
 		 753 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  21.68 
 
 		 772 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  21.27 
 
 		 766 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  20.78 
 
 		 753 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  22.64 
 
 		 723 aa  73.6  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  20.78 
 
 		 762 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  21.11 
 
 		 753 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  20.36 
 
 		 788 aa  72.8  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  19.93 
 
 		 756 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  21.41 
 
 		 785 aa  73.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  20.97 
 
 		 774 aa  72  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  21.58 
 
 		 676 aa  70.9  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  25.97 
 
 		 938 aa  70.5  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  20.72 
 
 		 801 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  20.57 
 
 		 785 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  21.27 
 
 		 798 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  25.85 
 
 		 791 aa  67.8  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  20.49 
 
 		 746 aa  67  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  20.83 
 
 		 807 aa  67  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  21.5 
 
 		 791 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  20.49 
 
 		 755 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  22.02 
 
 		 777 aa  66.6  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  20.97 
 
 		 745 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  20.27 
 
 		 654 aa  65.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  20.75 
 
 		 773 aa  65.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  20.97 
 
 		 773 aa  65.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  20.49 
 
 		 755 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  30.63 
 
 		 749 aa  65.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  22.67 
 
 		 841 aa  63.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  21.48 
 
 		 852 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  24.9 
 
 		 773 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  19.67 
 
 		 757 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  20.3 
 
 		 790 aa  59.3  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  23.14 
 
 		 739 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  24.71 
 
 		 835 aa  58.5  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  24.63 
 
 		 739 aa  57.8  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  25.1 
 
 		 788 aa  57.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  23.18 
 
 		 797 aa  57.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  24.12 
 
 		 798 aa  57.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  23.41 
 
 		 874 aa  57.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  22.73 
 
 		 726 aa  57  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  21.95 
 
 		 707 aa  57  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  22.18 
 
 		 729 aa  56.6  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  36.63 
 
 		 849 aa  55.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.56 
 
 		 909 aa  53.9  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  23.08 
 
 		 1067 aa  53.9  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  22.27 
 
 		 793 aa  53.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  28.38 
 
 		 782 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  18.33 
 
 		 855 aa  52  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  23.6 
 
 		 934 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  27.54 
 
 		 669 aa  51.6  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  26.94 
 
 		 669 aa  51.6  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  28.29 
 
 		 639 aa  51.2  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.11 
 
 		 929 aa  51.2  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  22.83 
 
 		 934 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.35 
 
 		 934 aa  50.4  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.35 
 
 		 934 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.35 
 
 		 934 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.35 
 
 		 934 aa  50.4  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.35 
 
 		 934 aa  50.4  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  22.83 
 
 		 934 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24 
 
 		 934 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  27.12 
 
 		 669 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24 
 
 		 934 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0728  helicase c2  23.02 
 
 		 471 aa  48.5  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.884524  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37740  predicted protein  38.71 
 
 		 849 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689797  normal  0.0804873 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  27.12 
 
 		 669 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  22.17 
 
 		 930 aa  47.8  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  27.37 
 
 		 614 aa  47.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>