More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7990 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  51.63 
 
 		 1214 aa  972    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  53.1 
 
 		 1213 aa  952    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  49.72 
 
 		 1194 aa  930    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  58.4 
 
 		 1183 aa  1073    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  50.72 
 
 		 1194 aa  954    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  48.98 
 
 		 1205 aa  906    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  51 
 
 		 1217 aa  967    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  56.8 
 
 		 1198 aa  1107    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  51.28 
 
 		 1195 aa  951    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  57.43 
 
 		 1191 aa  1148    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  53.83 
 
 		 1222 aa  992    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  53.94 
 
 		 1191 aa  1015    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  56.56 
 
 		 1198 aa  1093    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  41.34 
 
 		 1172 aa  679    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  65.02 
 
 		 1218 aa  1172    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  51.29 
 
 		 1194 aa  996    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  55.29 
 
 		 1194 aa  1132    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  69.9 
 
 		 1234 aa  1213    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  41.52 
 
 		 1225 aa  756    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  54.79 
 
 		 1191 aa  991    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  50.9 
 
 		 1222 aa  985    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  59.32 
 
 		 1224 aa  1232    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  57.23 
 
 		 1188 aa  1147    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  100 
 
 		 1227 aa  2349    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  58.1 
 
 		 1181 aa  590  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  66.99 
 
 		 1199 aa  504  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  70.09 
 
 		 1188 aa  506  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  70.1 
 
 		 1186 aa  499  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  71.12 
 
 		 1188 aa  496  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  65.96 
 
 		 1203 aa  464  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.85 
 
 		 1185 aa  463  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  54.03 
 
 		 1263 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  62.26 
 
 		 1195 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.09 
 
 		 1176 aa  451  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  25.82 
 
 		 1185 aa  452  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  26.43 
 
 		 1185 aa  453  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  29.56 
 
 		 1189 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  29.56 
 
 		 1189 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  28.81 
 
 		 1189 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  62.92 
 
 		 1217 aa  449  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  62.26 
 
 		 1195 aa  449  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  29.13 
 
 		 1186 aa  449  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  62.26 
 
 		 1195 aa  449  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  28.81 
 
 		 1189 aa  446  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  30.19 
 
 		 1204 aa  431  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  29.45 
 
 		 1186 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.77 
 
 		 1187 aa  421  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  27.01 
 
 		 1148 aa  413  1e-113  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  28.36 
 
 		 1177 aa  398  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.28 
 
 		 1178 aa  393  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.63 
 
 		 1177 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  23.28 
 
 		 1180 aa  360  6e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  27.95 
 
 		 1169 aa  358  3.9999999999999996e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  27.87 
 
 		 1169 aa  356  2e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  25.24 
 
 		 1170 aa  332  3e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  29.85 
 
 		 1165 aa  319  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.23 
 
 		 1164 aa  315  2.9999999999999996e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  32.28 
 
 		 1189 aa  301  6e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  29.97 
 
 		 1190 aa  301  6e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  32.78 
 
 		 1189 aa  299  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  29.59 
 
 		 1190 aa  298  4e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  30.84 
 
 		 1189 aa  293  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  31.62 
 
 		 1189 aa  291  6e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  31.62 
 
 		 1189 aa  291  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  31.48 
 
 		 1189 aa  291  7e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  57.98 
 
 		 1186 aa  289  2.9999999999999996e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  30.81 
 
 		 1188 aa  288  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  30.81 
 
 		 1188 aa  288  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  31.9 
 
 		 1179 aa  287  7e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  48.12 
 
 		 1184 aa  283  1e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  29.94 
 
 		 1196 aa  282  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  29.4 
 
 		 1189 aa  281  4e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  35.23 
 
 		 1187 aa  281  6e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  35.44 
 
 		 1185 aa  280  8e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  29.96 
 
 		 1191 aa  280  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  20.98 
 
 		 1174 aa  280  2e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  54.71 
 
 		 1185 aa  278  3e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  33.66 
 
 		 1301 aa  275  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  34.04 
 
 		 1175 aa  268  7e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  44.09 
 
 		 1190 aa  258  6e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  25.71 
 
 		 1175 aa  252  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  46.13 
 
 		 1179 aa  252  4e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  26.34 
 
 		 1146 aa  251  5e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  24.81 
 
 		 1219 aa  248  4.9999999999999997e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  23.09 
 
 		 1191 aa  243  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  51.2 
 
 		 1185 aa  241  5.999999999999999e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  30.69 
 
 		 1176 aa  239  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  43.99 
 
 		 1173 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  26.99 
 
 		 1146 aa  238  6e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  30.07 
 
 		 1187 aa  234  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  52.36 
 
 		 1081 aa  234  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  24.89 
 
 		 1226 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  22.77 
 
 		 1189 aa  228  4e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  30.48 
 
 		 1176 aa  228  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  30.25 
 
 		 1163 aa  228  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  27.29 
 
 		 1186 aa  226  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  46.76 
 
 		 1174 aa  224  4.9999999999999996e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  45 
 
 		 1255 aa  224  8e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  24.68 
 
 		 1217 aa  222  3.9999999999999997e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25.35 
 
 		 1207 aa  221  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>