165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7173 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  100 
 
 		 433 aa  888    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  63.08 
 
 		 432 aa  548  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  44.09 
 
 		 422 aa  345  8e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  45.41 
 
 		 434 aa  345  8.999999999999999e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  44.92 
 
 		 435 aa  332  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  40.5 
 
 		 432 aa  309  5e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  41.1 
 
 		 450 aa  308  9e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  37.33 
 
 		 438 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  42.14 
 
 		 447 aa  296  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  39.27 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  38.72 
 
 		 424 aa  279  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  39.81 
 
 		 428 aa  272  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  39.76 
 
 		 428 aa  271  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  37.12 
 
 		 462 aa  265  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  35.62 
 
 		 434 aa  236  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  36.26 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  37.16 
 
 		 430 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  32.11 
 
 		 433 aa  220  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  34.63 
 
 		 446 aa  219  8.999999999999998e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  37.11 
 
 		 441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  34.4 
 
 		 435 aa  217  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2611  extracellular solute-binding protein family 1  33.53 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606136  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 		 417 aa  154  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  29.58 
 
 		 430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.41 
 
 		 416 aa  136  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  28.49 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 452 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  28.42 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.85 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  29.21 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  23.48 
 
 		 437 aa  99.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 424 aa  90.5  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 444 aa  90.1  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  34.59 
 
 		 229 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 445 aa  89  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 442 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  26.41 
 
 		 446 aa  87.4  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.84 
 
 		 450 aa  87.4  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 449 aa  86.7  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 445 aa  86.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  24.32 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  23.38 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.56 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  21.76 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2112  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0884714  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  22.11 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  22.27 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.41 
 
 		 458 aa  67  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.6 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.09 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1435  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.87 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0110058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1957  extracellular solute-binding protein  21.86 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000130159  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06942  hypothetical protein  32.41 
 
 		 157 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  33.79 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  22.35 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  22.97 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.13 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  20.76 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 424 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.38 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 429 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.63 
 
 		 426 aa  54.3  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 429 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.41 
 
 		 438 aa  53.9  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 411 aa  53.1  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 430 aa  53.5  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  23.34 
 
 		 449 aa  53.1  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  33.61 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  30.07 
 
 		 449 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  22.3 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  22.05 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  21.5 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  20.7 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>