More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0196 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 967 aa  1936    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  41.85 
 
 		 965 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  38.55 
 
 		 928 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  38.13 
 
 		 919 aa  506  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  37.63 
 
 		 946 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  36.2 
 
 		 930 aa  463  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  35.09 
 
 		 993 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  37.32 
 
 		 970 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  37.62 
 
 		 964 aa  452  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  37.49 
 
 		 908 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  35.66 
 
 		 956 aa  436  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  34.88 
 
 		 921 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  35.48 
 
 		 928 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  34.69 
 
 		 907 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  33.37 
 
 		 941 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  33.26 
 
 		 931 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 814 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  33.76 
 
 		 1025 aa  360  5e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  33.15 
 
 		 993 aa  358  2.9999999999999997e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  33.7 
 
 		 1088 aa  349  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  33.91 
 
 		 937 aa  348  4e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  32.46 
 
 		 1020 aa  342  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  30.38 
 
 		 1027 aa  341  5e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  31.12 
 
 		 981 aa  339  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 1048 aa  338  2.9999999999999997e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  35.85 
 
 		 1008 aa  337  5e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  38.36 
 
 		 995 aa  336  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  35.28 
 
 		 806 aa  334  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  31.46 
 
 		 934 aa  332  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  31.37 
 
 		 996 aa  326  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  32.6 
 
 		 940 aa  323  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 1071 aa  321  5e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  36.45 
 
 		 1014 aa  319  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  30.15 
 
 		 1022 aa  315  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  32.32 
 
 		 982 aa  315  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  38.39 
 
 		 1030 aa  315  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 757 aa  312  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  29.77 
 
 		 1108 aa  310  8e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  30.37 
 
 		 913 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  31.62 
 
 		 1010 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  32.97 
 
 		 962 aa  304  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  30.17 
 
 		 990 aa  303  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  34.3 
 
 		 1033 aa  302  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  32.28 
 
 		 954 aa  302  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  33.78 
 
 		 1034 aa  301  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  33.19 
 
 		 965 aa  298  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32 
 
 		 921 aa  299  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.53 
 
 		 742 aa  298  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  35.97 
 
 		 990 aa  298  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  38.72 
 
 		 1001 aa  293  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  30.88 
 
 		 992 aa  292  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  35.11 
 
 		 838 aa  291  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  29.43 
 
 		 992 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  35.69 
 
 		 775 aa  286  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  34.16 
 
 		 797 aa  285  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  32.28 
 
 		 788 aa  284  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  35.43 
 
 		 915 aa  283  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  30.4 
 
 		 1138 aa  280  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  29.8 
 
 		 1011 aa  278  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 		 850 aa  274  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  35.49 
 
 		 983 aa  273  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  32.68 
 
 		 935 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  30.45 
 
 		 1022 aa  271  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  31.7 
 
 		 978 aa  271  5e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  32.49 
 
 		 790 aa  271  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  28.06 
 
 		 1017 aa  269  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  32.35 
 
 		 1003 aa  267  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  31.15 
 
 		 950 aa  262  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 		 755 aa  261  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  33.94 
 
 		 1003 aa  258  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  38.84 
 
 		 715 aa  258  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  31.66 
 
 		 1025 aa  255  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  29.47 
 
 		 971 aa  254  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  33.87 
 
 		 963 aa  250  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  31.26 
 
 		 783 aa  248  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  30.27 
 
 		 1013 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  37.65 
 
 		 496 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  28.96 
 
 		 1021 aa  245  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  31.37 
 
 		 1003 aa  242  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  28.87 
 
 		 1030 aa  241  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  31.77 
 
 		 926 aa  238  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  31.3 
 
 		 989 aa  233  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  32.07 
 
 		 621 aa  230  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  30.33 
 
 		 775 aa  228  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 453 aa  226  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  32.66 
 
 		 792 aa  224  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 654 aa  221  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4985  Tetratricopeptide TPR_4  32.69 
 
 		 687 aa  215  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.688243  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 622 aa  214  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  32.44 
 
 		 582 aa  213  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 1319 aa  212  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  32.35 
 
 		 910 aa  210  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  34.75 
 
 		 915 aa  209  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  31.16 
 
 		 690 aa  205  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  32.36 
 
 		 632 aa  202  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1806  transcriptional regulator, SARP family  26.87 
 
 		 1060 aa  202  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287202  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  26.77 
 
 		 1033 aa  201  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  28.79 
 
 		 981 aa  200  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0225  transcriptional regulator, XRE family  31.77 
 
 		 792 aa  198  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 1346 aa  198  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>