More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1160 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  71.55 
 
 		 503 aa  635    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  100 
 
 		 486 aa  956    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  65.9 
 
 		 521 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  55.01 
 
 		 496 aa  511  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  56.25 
 
 		 492 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  52.9 
 
 		 482 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  49.13 
 
 		 524 aa  410  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  48.59 
 
 		 503 aa  402  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  47.22 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  44.59 
 
 		 465 aa  355  6.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  46.38 
 
 		 481 aa  308  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  37.44 
 
 		 469 aa  300  4e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  36.77 
 
 		 469 aa  294  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  36.61 
 
 		 469 aa  293  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  36.61 
 
 		 469 aa  293  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  36.61 
 
 		 469 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  36.83 
 
 		 469 aa  293  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  36.83 
 
 		 469 aa  293  7e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  36.61 
 
 		 469 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  36.83 
 
 		 469 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  36.64 
 
 		 469 aa  280  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  36.64 
 
 		 469 aa  280  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  38.07 
 
 		 471 aa  273  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  36.99 
 
 		 469 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  37.01 
 
 		 469 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  37.22 
 
 		 480 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  34.44 
 
 		 478 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  37.13 
 
 		 455 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  36.78 
 
 		 476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  37.22 
 
 		 455 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  37.22 
 
 		 455 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  34.72 
 
 		 491 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  34.84 
 
 		 449 aa  230  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  34.19 
 
 		 458 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  33.63 
 
 		 449 aa  219  6e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  35.17 
 
 		 436 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  34.38 
 
 		 448 aa  215  1.9999999999999998e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 460 aa  197  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  32.74 
 
 		 486 aa  193  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  29.94 
 
 		 485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  30.24 
 
 		 468 aa  181  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 448 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  28.03 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  29.08 
 
 		 454 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  28.06 
 
 		 518 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  28.66 
 
 		 490 aa  171  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  29.66 
 
 		 499 aa  169  9e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 462 aa  168  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  30.02 
 
 		 477 aa  166  9e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  32.49 
 
 		 442 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  28.75 
 
 		 538 aa  160  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 500 aa  159  8e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 457 aa  156  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  29.3 
 
 		 449 aa  156  9e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  29.94 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  27.49 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 498 aa  153  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 446 aa  153  5e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 453 aa  153  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.57 
 
 		 525 aa  152  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 443 aa  152  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 467 aa  152  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  29.7 
 
 		 481 aa  151  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 451 aa  151  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 461 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.17 
 
 		 462 aa  150  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1642  Na+ driven multidrug antiporter, C-terminus  36.05 
 
 		 270 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  29.3 
 
 		 554 aa  150  7e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  36.87 
 
 		 238 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2736  MATE efflux family protein  34.34 
 
 		 452 aa  147  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.01 
 
 		 448 aa  146  8.000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25.17 
 
 		 454 aa  143  7e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  30.86 
 
 		 500 aa  143  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 470 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 522 aa  139  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  30.88 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 445 aa  137  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 453 aa  137  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 458 aa  136  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  30.3 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  25.16 
 
 		 463 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  24.45 
 
 		 475 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  35.15 
 
 		 494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 468 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  27.23 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  28.83 
 
 		 483 aa  123  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 438 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 469 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  26.58 
 
 		 463 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  23.64 
 
 		 475 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>