More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3946 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  39.4 
 
 		 1135 aa  652    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  79.98 
 
 		 1038 aa  1740    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  47.76 
 
 		 1138 aa  919    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  56.55 
 
 		 1165 aa  1186    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  57.14 
 
 		 1073 aa  1199    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1043 aa  2110    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  38.79 
 
 		 1022 aa  629  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  37.67 
 
 		 1063 aa  619  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  37.8 
 
 		 1033 aa  602  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  35.73 
 
 		 1153 aa  580  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  35.97 
 
 		 1142 aa  572  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  35.06 
 
 		 1036 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  35.24 
 
 		 1147 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1059 aa  556  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  34.88 
 
 		 1032 aa  546  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  34.45 
 
 		 1051 aa  517  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  32.81 
 
 		 1074 aa  515  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 		 1031 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 		 1129 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  32.38 
 
 		 1058 aa  489  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  34.11 
 
 		 1065 aa  486  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 1105 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  32.56 
 
 		 1040 aa  482  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 		 1051 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  33.71 
 
 		 1063 aa  473  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  32 
 
 		 1065 aa  469  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 1093 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 1234 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  31.12 
 
 		 1071 aa  451  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1038 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  31.83 
 
 		 1087 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  32.02 
 
 		 1028 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 1059 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 1072 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1081 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 1081 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  30.91 
 
 		 1083 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 1163 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1169 aa  418  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1071 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  34.1 
 
 		 1137 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1059 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  33.74 
 
 		 1115 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  32.01 
 
 		 1088 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1068 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 1039 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 1127 aa  406  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 1081 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1189 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1041 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 1064 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  30.54 
 
 		 1010 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 1047 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 1043 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1099 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 1073 aa  393  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1011 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 1098 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 1033 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 1050 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 1166 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 1101 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 1078 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 		 1071 aa  383  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 1067 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 		 1044 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1107 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1153 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1102 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1186 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 1098 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  28.78 
 
 		 1025 aa  340  7e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1138 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1084 aa  332  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 1027 aa  324  6e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1088 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1008 aa  320  1e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 1057 aa  309  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1116 aa  292  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 1027 aa  291  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 1079 aa  280  9e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1129 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1023 aa  276  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1066 aa  275  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1161 aa  274  7e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 1037 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 1028 aa  263  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1046 aa  263  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  27.72 
 
 		 1010 aa  261  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1040 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 1050 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 1038 aa  253  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 1155 aa  252  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 1063 aa  251  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  25.79 
 
 		 1096 aa  250  8e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 1155 aa  249  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  27.19 
 
 		 1035 aa  248  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 996 aa  248  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  25.25 
 
 		 1017 aa  248  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 1177 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>