More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0902 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 		 625 aa  1246    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  59.75 
 
 		 587 aa  644    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  75.46 
 
 		 594 aa  816    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  56.46 
 
 		 616 aa  606  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  57.43 
 
 		 584 aa  587  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  53.54 
 
 		 599 aa  570  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  56.75 
 
 		 574 aa  569  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  50.49 
 
 		 595 aa  554  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  47.05 
 
 		 595 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  48.59 
 
 		 609 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  43.47 
 
 		 620 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  36.19 
 
 		 613 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 		 607 aa  288  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  36.36 
 
 		 613 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  34.05 
 
 		 607 aa  286  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  34.22 
 
 		 607 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  34.22 
 
 		 607 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  34.22 
 
 		 607 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  33.44 
 
 		 607 aa  281  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  33.44 
 
 		 607 aa  281  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  34.61 
 
 		 613 aa  281  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  34.72 
 
 		 606 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  34.72 
 
 		 606 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  34.72 
 
 		 606 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  34.72 
 
 		 606 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  34.54 
 
 		 606 aa  278  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 606 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  34.72 
 
 		 606 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 606 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  33.98 
 
 		 635 aa  270  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  31.75 
 
 		 573 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 616 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.9 
 
 		 571 aa  249  8e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  31.44 
 
 		 562 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  33.04 
 
 		 642 aa  239  8e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  32.74 
 
 		 645 aa  239  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.69 
 
 		 645 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 		 572 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  34.98 
 
 		 592 aa  229  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 581 aa  212  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  30.02 
 
 		 573 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 573 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  28.01 
 
 		 590 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 573 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 573 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  28.77 
 
 		 575 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  28.62 
 
 		 575 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 575 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 556 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  28.5 
 
 		 574 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  30.34 
 
 		 584 aa  159  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  28.93 
 
 		 603 aa  158  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  50.96 
 
 		 494 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.93 
 
 		 553 aa  157  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.1 
 
 		 574 aa  154  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  28.92 
 
 		 520 aa  152  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  49.04 
 
 		 495 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 585 aa  146  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 		 594 aa  140  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  36.09 
 
 		 586 aa  139  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.32 
 
 		 574 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  35.77 
 
 		 591 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.94 
 
 		 582 aa  130  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  34.29 
 
 		 619 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.45 
 
 		 564 aa  121  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 567 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3601  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 603 aa  121  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.36082  normal  0.484683 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 464 aa  106  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  28.55 
 
 		 551 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 562 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.8 
 
 		 563 aa  99  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 677 aa  98.2  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.43 
 
 		 557 aa  97.8  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 607 aa  96.3  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  27.8 
 
 		 619 aa  94  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 		 559 aa  93.2  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.35 
 
 		 581 aa  92.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  30.8 
 
 		 559 aa  92.8  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 595 aa  90.9  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 572 aa  89.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.68 
 
 		 599 aa  89  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  31.19 
 
 		 621 aa  88.2  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  31.19 
 
 		 621 aa  88.2  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  29.17 
 
 		 593 aa  88.2  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 621 aa  87.8  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 638 aa  87.4  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  30.29 
 
 		 583 aa  87  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 566 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.29 
 
 		 610 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  26.94 
 
 		 425 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  25.81 
 
 		 573 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 610 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 617 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 642 aa  84.3  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  27.5 
 
 		 573 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 573 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  29.13 
 
 		 572 aa  83.2  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.56 
 
 		 572 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 566 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  32.65 
 
 		 632 aa  82  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>