255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0390 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  67.48 
 
 		 574 aa  833    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  100 
 
 		 580 aa  1172    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  61.81 
 
 		 575 aa  758    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  61.72 
 
 		 582 aa  769    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  32.94 
 
 		 634 aa  276  7e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  29.4 
 
 		 588 aa  198  3e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  28.06 
 
 		 550 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  27.53 
 
 		 541 aa  144  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  26.7 
 
 		 619 aa  138  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  27.18 
 
 		 781 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  26.66 
 
 		 781 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  23.37 
 
 		 790 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  22.93 
 
 		 712 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  25.73 
 
 		 785 aa  114  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  24.74 
 
 		 785 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0134  DEAD_2 domain-containing protein  24 
 
 		 537 aa  110  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117441 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  24.39 
 
 		 537 aa  110  8.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  24.62 
 
 		 753 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  23.18 
 
 		 774 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  25.62 
 
 		 617 aa  107  9e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  23.82 
 
 		 777 aa  106  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  23.94 
 
 		 762 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  24.23 
 
 		 753 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  24.08 
 
 		 775 aa  103  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  23.41 
 
 		 670 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  24.32 
 
 		 761 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  23.57 
 
 		 753 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  25.16 
 
 		 750 aa  99  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  25.04 
 
 		 852 aa  99.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  24.38 
 
 		 654 aa  97.4  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  22.71 
 
 		 798 aa  95.9  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  22.61 
 
 		 849 aa  95.1  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  22.12 
 
 		 798 aa  95.1  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  23.13 
 
 		 772 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  23.7 
 
 		 773 aa  90.9  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  22.66 
 
 		 773 aa  87  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  22.26 
 
 		 758 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.09 
 
 		 676 aa  84.7  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  23.09 
 
 		 723 aa  83.6  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  22.07 
 
 		 758 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  21.84 
 
 		 797 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  22.03 
 
 		 669 aa  81.3  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  23.21 
 
 		 754 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  23.12 
 
 		 729 aa  80.9  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  22.4 
 
 		 938 aa  79.7  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  24.19 
 
 		 766 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  23.57 
 
 		 798 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  22.56 
 
 		 779 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  30.45 
 
 		 723 aa  79  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  27.62 
 
 		 739 aa  78.2  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  23.11 
 
 		 669 aa  78.2  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  22.67 
 
 		 661 aa  77.8  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  23.89 
 
 		 754 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  22.83 
 
 		 766 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  22.67 
 
 		 766 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  27.71 
 
 		 874 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  22.4 
 
 		 807 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  22.45 
 
 		 841 aa  76.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  22.48 
 
 		 766 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  22.68 
 
 		 788 aa  75.5  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  22.08 
 
 		 835 aa  73.9  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  23.08 
 
 		 756 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  22.41 
 
 		 766 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  22.41 
 
 		 766 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  28.19 
 
 		 801 aa  72  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  22.67 
 
 		 757 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  22.07 
 
 		 745 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  27.61 
 
 		 793 aa  69.7  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  22.5 
 
 		 766 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.01 
 
 		 921 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  23.71 
 
 		 641 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  25.94 
 
 		 722 aa  68.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  21.29 
 
 		 1067 aa  67.8  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  22.45 
 
 		 755 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  23.87 
 
 		 647 aa  67.4  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  23.76 
 
 		 739 aa  67.4  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  21.84 
 
 		 746 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  21.84 
 
 		 755 aa  67  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  28.9 
 
 		 669 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  25.29 
 
 		 799 aa  65.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  29.08 
 
 		 669 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.57 
 
 		 957 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  27.91 
 
 		 773 aa  65.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.03 
 
 		 934 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.03 
 
 		 934 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  27.87 
 
 		 634 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  27.87 
 
 		 634 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  27.87 
 
 		 634 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  24.71 
 
 		 791 aa  65.1  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  23.51 
 
 		 641 aa  65.1  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  23.51 
 
 		 641 aa  65.1  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  28.84 
 
 		 788 aa  64.3  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  22.61 
 
 		 649 aa  63.9  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  23.81 
 
 		 791 aa  63.9  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  25.94 
 
 		 726 aa  63.9  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.44 
 
 		 934 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  27.44 
 
 		 790 aa  63.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  21.32 
 
 		 674 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0979  helicase domain-containing protein  24.9 
 
 		 706 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0544879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.03 
 
 		 929 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>