More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1972 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1972  diguanylate cyclase  100 
 
 		 506 aa  1045    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.719154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2091  diguanylate cyclase  38.78 
 
 		 325 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2044  diguanylate cyclase  38.1 
 
 		 325 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.82426  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  38.89 
 
 		 631 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1806  diguanylate cyclase  34.88 
 
 		 473 aa  104  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.782438  hitchhiker  0.00449211 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2282  diguanylate cyclase  37.41 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4568  hypothetical protein  37.41 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0452  sensory box protein  36.26 
 
 		 451 aa  103  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0308  diguanylate cyclase  36.32 
 
 		 581 aa  103  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164957 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1721  diguanylate cyclase  40.62 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.176219  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1980  diguanylate cyclase  40.88 
 
 		 417 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0208161  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1751  diguanylate cyclase  28.12 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1085  diguanylate cyclase  38.13 
 
 		 357 aa  101  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0422  diguanylate cyclase  35.48 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3476  diguanylate cyclase  28.67 
 
 		 298 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0198  diguanylate cyclase  36.91 
 
 		 312 aa  100  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  38.69 
 
 		 417 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0651  diguanylate cyclase  38.36 
 
 		 574 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000777615  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2151  diguanylate cyclase  41.22 
 
 		 583 aa  99.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.984421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0319  diguanylate cyclase  42.19 
 
 		 732 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1203  response regulator  38.46 
 
 		 634 aa  99  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3800  diguanylate cyclase  38.19 
 
 		 553 aa  99  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1382  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.86 
 
 		 889 aa  99  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231857  normal  0.133175 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.32 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1702  diguanylate cyclase  34.56 
 
 		 370 aa  99  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1355  diguanylate cyclase  38.36 
 
 		 487 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133394  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4104  diguanylate cyclase  39.58 
 
 		 610 aa  98.2  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.147884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 578 aa  98.2  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2580  GGDEF domain-containing protein  41.1 
 
 		 1774 aa  97.8  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1949  sensory box protein  44.88 
 
 		 654 aa  97.8  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  41.54 
 
 		 461 aa  97.8  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1357  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.36 
 
 		 901 aa  97.4  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351362  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2679  diguanylate cyclase  42.61 
 
 		 459 aa  97.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12380  diguanylate cyclase  40.31 
 
 		 499 aa  97.1  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00534046  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2731  diguanylate cyclase  30.95 
 
 		 714 aa  97.1  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3835  diguanylate cyclase  35.76 
 
 		 316 aa  97.4  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  39.86 
 
 		 1774 aa  97.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2322  diguanylate cyclase  39.55 
 
 		 354 aa  97.1  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3168  diguanylate cyclase  43.18 
 
 		 362 aa  97.1  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0125  GGDEF domain-containing protein  30.12 
 
 		 371 aa  96.7  8e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0867  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.68 
 
 		 312 aa  97.1  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.711393  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3048  diguanylate cyclase  35.25 
 
 		 398 aa  96.7  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795755  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3480  diguanylate cyclase  35.9 
 
 		 395 aa  96.7  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232889  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  38.78 
 
 		 457 aa  96.7  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  34.33 
 
 		 563 aa  96.7  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3922  GGDEF domain-containing protein  35.22 
 
 		 364 aa  96.3  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02325  GGDEF domain protein  38.19 
 
 		 949 aa  96.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2371  diguanylate cyclase  37.84 
 
 		 294 aa  96.3  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.191081 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0223  diguanylate cyclase  37.1 
 
 		 357 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.133267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  39.29 
 
 		 612 aa  96.3  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.33 
 
 		 800 aa  95.9  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0426061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  34.32 
 
 		 1826 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4131  diguanylate cyclase  37.32 
 
 		 369 aa  96.3  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0413  diguanylate cyclase  40.49 
 
 		 373 aa  96.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  34.33 
 
 		 564 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  38.03 
 
 		 457 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2287  diguanylate cyclase  31.55 
 
 		 764 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0235  GAF/GGDEF domain-containing protein  42.75 
 
 		 391 aa  95.9  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0652  diguanylate cyclase  28.32 
 
 		 566 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.660583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  39.46 
 
 		 457 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0319  two component diguanylate cyclase  42.34 
 
 		 661 aa  95.5  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00151  Response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  33.93 
 
 		 353 aa  95.5  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440614  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  41.48 
 
 		 758 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0215  GAF/GGDEF domain-containing protein  42.75 
 
 		 391 aa  95.9  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1677  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.69 
 
 		 512 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00717505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4369  sensor diguanylate cyclase  35.29 
 
 		 569 aa  95.5  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.399197 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1306  diguanylate cyclase  42.06 
 
 		 615 aa  95.5  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.550913  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04010  diguanylate cyclase  42.37 
 
 		 556 aa  94.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000479519  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3654  diguanylate cyclase  35.71 
 
 		 473 aa  94.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271139  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2375  diguanylate cyclase  31.55 
 
 		 764 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2249  response regulator/GGDEF domain-containing protein  33.12 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0569  diguanylate cyclase  36.73 
 
 		 403 aa  95.1  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.06 
 
 		 464 aa  95.1  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.679076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  31.11 
 
 		 466 aa  95.1  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4122  diguanylate cyclase  35.26 
 
 		 395 aa  95.1  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.519011 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0638  diguanylate cyclase  35.37 
 
 		 524 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484455 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3824  diguanylate cyclase  41.54 
 
 		 659 aa  95.1  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0841  GGDEF family protein  39.37 
 
 		 372 aa  94.4  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000214515  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0835  diguanylate cyclase  33.55 
 
 		 443 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.153525  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2643  diguanylate cyclase  39.57 
 
 		 470 aa  94.4  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1576  diguanylate cyclase  46.39 
 
 		 764 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3939  response regulator receiver domain-containing protein  40.27 
 
 		 588 aa  94.4  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.238688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1198  diguanylate cyclase  39.71 
 
 		 394 aa  94.4  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000754903  normal  0.715416 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0797  diguanylate cyclase  39.06 
 
 		 385 aa  94.4  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3856  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  38.57 
 
 		 1216 aa  94.7  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0462  3-deoxy-d-manno-octulosonic-acid transferase  38.71 
 
 		 422 aa  94.4  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  39.1 
 
 		 554 aa  94.4  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4904  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.89 
 
 		 642 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0484368  normal  0.638753 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.32 
 
 		 962 aa  94.4  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3023  diguanylate cyclase  32.93 
 
 		 362 aa  94  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4930  diguanylate cyclase  38.24 
 
 		 530 aa  94  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22973 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1066  diguanylate cyclase  37.93 
 
 		 504 aa  94  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1695  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.46 
 
 		 594 aa  94  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1056  diguanylate cyclase  43.61 
 
 		 580 aa  93.6  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.77678  normal  0.689214 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0610  response regulator PleD  40.3 
 
 		 461 aa  93.6  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.961713  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0575  response regulator PleD  40.3 
 
 		 456 aa  93.6  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1328  diguanylate cyclase  36.43 
 
 		 564 aa  93.6  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0263917  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3673  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  40 
 
 		 1262 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2693  diguanylate cyclase  41.98 
 
 		 570 aa  92.8  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1658  diguanylate cyclase  39.23 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.287196  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>