150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1064 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  100 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  77.23 
 
 		 202 aa  279  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  60 
 
 		 223 aa  221  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  33.18 
 
 		 217 aa  111  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  53.61 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  29.44 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  34.62 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  33.17 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  28.99 
 
 		 206 aa  95.5  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  32.18 
 
 		 204 aa  95.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  28.16 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  31.1 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  30.85 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  32.21 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  32.21 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  32.69 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  29.8 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  31.25 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  32.21 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  34.16 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  31.25 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  31.25 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  31.73 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  32.84 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  31.63 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  31.63 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  32.35 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  30.37 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  31.73 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  33.49 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  30.46 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  31.71 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  32.14 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  30.61 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  29.44 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  33.01 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  28.87 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  30.35 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4060  TonB family protein  42.7 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.910663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  30.73 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  33.85 
 
 		 131 aa  73.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  29.11 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05000  TonB protein  43.82 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00767831  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3238  tonB protein, putative  43.82 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.70516  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  28.78 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00633  periplasmic protein TonB  30.05 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  39.53 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0113  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  38.2 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.158306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0712  TonB family protein  43.21 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.877696  normal  0.702571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  35.79 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  37.21 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  33.72 
 
 		 467 aa  58.9  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  31.96 
 
 		 368 aa  58.9  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  36.36 
 
 		 403 aa  58.9  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  29.93 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  30.34 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  33.78 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  36.49 
 
 		 305 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  29.41 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  34.41 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  30.95 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  44.44 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  35.48 
 
 		 458 aa  55.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  32.94 
 
 		 370 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  31.76 
 
 		 369 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  44.44 
 
 		 371 aa  55.1  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  31.76 
 
 		 370 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  34.94 
 
 		 259 aa  54.7  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  32.14 
 
 		 405 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  32.89 
 
 		 373 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  35.48 
 
 		 417 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  31.4 
 
 		 392 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  38.03 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  34.88 
 
 		 367 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  25.24 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  41.79 
 
 		 260 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  31.76 
 
 		 371 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  31.76 
 
 		 371 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  44.07 
 
 		 115 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  42.03 
 
 		 277 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3868  TonB family protein  41.1 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  32.22 
 
 		 362 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  32.86 
 
 		 371 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  31.76 
 
 		 369 aa  52.8  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  34.74 
 
 		 565 aa  52.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  28.41 
 
 		 361 aa  52  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  39.68 
 
 		 334 aa  52  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  38.89 
 
 		 275 aa  52  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  34.12 
 
 		 404 aa  52  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  36.67 
 
 		 390 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  32.94 
 
 		 370 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  36.25 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  38.37 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  31.46 
 
 		 354 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  27.56 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  36.25 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  36.25 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 		 349 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  30.38 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  36.25 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>