123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04406 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  100 
 
 		 766 aa  1553    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  29.36 
 
 		 760 aa  283  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  29.48 
 
 		 760 aa  283  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 747 aa  274  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 746 aa  253  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 815 aa  193  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 782 aa  169  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 792 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 747 aa  145  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 772 aa  137  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 798 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 729 aa  135  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 768 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 753 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 786 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 828 aa  127  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 738 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 738 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  23.04 
 
 		 768 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 777 aa  109  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 736 aa  103  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 841 aa  103  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 796 aa  99.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  23.21 
 
 		 734 aa  97.8  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 791 aa  97.8  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 780 aa  90.9  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 781 aa  88.6  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 766 aa  86.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  28.63 
 
 		 730 aa  85.1  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 765 aa  84.3  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 768 aa  84.3  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 777 aa  81.6  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  26.71 
 
 		 741 aa  79.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2298  TonB-dependent receptor  22.13 
 
 		 735 aa  78.2  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.951085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  22.13 
 
 		 735 aa  78.2  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 835 aa  76.6  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 781 aa  74.7  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 792 aa  74.3  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1166  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 765 aa  73.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  24.14 
 
 		 740 aa  72.8  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 756 aa  72.4  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  26.89 
 
 		 814 aa  71.6  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 790 aa  70.9  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 762 aa  66.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  31.51 
 
 		 914 aa  64.3  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3784  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 772 aa  64.3  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.562566 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  25.08 
 
 		 740 aa  63.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 958 aa  62.8  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  22.49 
 
 		 733 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 854 aa  62  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 808 aa  61.6  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 790 aa  61.2  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 754 aa  61.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 754 aa  61.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 786 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  25.81 
 
 		 793 aa  58.2  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  20.48 
 
 		 742 aa  57.4  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  22.31 
 
 		 701 aa  53.5  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0121  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 681 aa  53.5  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 791 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  26.2 
 
 		 942 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  20.99 
 
 		 706 aa  51.6  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  20.99 
 
 		 706 aa  51.6  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_002950  PG1899  TonB-dependent receptor, putative  24.71 
 
 		 794 aa  51.6  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  23.14 
 
 		 773 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 799 aa  51.2  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  23.79 
 
 		 724 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  20.88 
 
 		 699 aa  49.7  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  24.37 
 
 		 667 aa  50.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  23.91 
 
 		 712 aa  49.3  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 711 aa  49.3  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  26.45 
 
 		 698 aa  49.3  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1414  hypothetical protein  25.88 
 
 		 871 aa  48.5  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.530363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 768 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 760 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0908  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 778 aa  48.5  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0763  TonB-dependent receptor, putative  22.31 
 
 		 778 aa  48.5  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 780 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  25.18 
 
 		 763 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 732 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 782 aa  47.8  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 768 aa  47.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 734 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2998  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 799 aa  47.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  25.62 
 
 		 693 aa  47.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  24.69 
 
 		 718 aa  47.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  28.57 
 
 		 803 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2608  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 824 aa  47.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 768 aa  47.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 735 aa  46.2  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 688 aa  46.6  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1484  hypothetical protein  28.99 
 
 		 398 aa  46.6  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2147  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 760 aa  46.2  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 778 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.24 
 
 		 706 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.24 
 
 		 706 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.24 
 
 		 706 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.24 
 
 		 706 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.24 
 
 		 721 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1199  hypothetical protein  28.99 
 
 		 398 aa  46.6  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052926 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>