More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0450 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 213 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  47.55 
 
 		 206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  41.58 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  38.13 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  55.38 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  35.77 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  56.14 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  53.97 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  31.85 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  48.05 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  40 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  37.01 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  46.99 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  33.01 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  43.01 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 497 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  22.4 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  36.43 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2865  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>