More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1336 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1336  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 653 aa  1335    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.474923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1439  type II secretion system protein D  44.31 
 
 		 656 aa  499  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0989759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2583  type II and III secretion system protein  39.39 
 
 		 749 aa  478  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1300  type II secretion system protein D  45.68 
 
 		 667 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.194357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  42.61 
 
 		 667 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29100  type II and III secretion system protein  39.9 
 
 		 614 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0223781  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02977  putative GSPD-related protein  39.21 
 
 		 754 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.220061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2414  type II and III secretion system protein  40.93 
 
 		 657 aa  425  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2468  type II and III secretion system protein  40.17 
 
 		 625 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.679634  normal  0.597766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3478  type II and III secretion system protein  38.64 
 
 		 621 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883707  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2293  type II and III secretion system protein  38.47 
 
 		 621 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.932026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2459  type II and III secretion system protein  38.31 
 
 		 621 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1987  type II and III secretion system protein  39.31 
 
 		 615 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0115184  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3884  type II and III secretion system protein  35.18 
 
 		 760 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2303  GSPD-like protein  38.74 
 
 		 789 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.109724  normal  0.194773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4706  putative secretion type II protein  37.04 
 
 		 734 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  37.5 
 
 		 812 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00431  putative general secretion pathway GSPD-related protein  38.69 
 
 		 698 aa  352  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2619  type II and III secretion system protein  38.05 
 
 		 662 aa  349  8e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1929  type II and III secretion system protein  32.38 
 
 		 796 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.114575  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1859  type II and III secretion system protein  33.16 
 
 		 861 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.765108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1284  type II and III secretion system protein  30.67 
 
 		 868 aa  296  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2999  type II and III secretion system protein  31.07 
 
 		 870 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000114171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1778  type II secretion system protein, putative  31.24 
 
 		 822 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0505418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1462  type II and III secretion system protein  32.92 
 
 		 769 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0136  putative type II secretion system protein  31.75 
 
 		 779 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3789  type II and III secretion system protein  32.48 
 
 		 596 aa  270  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1679  type II secretory pathway, component HofQ  30.91 
 
 		 767 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1469  type II and III secretion system protein  30.74 
 
 		 792 aa  250  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1997  type II and III secretion system protein  29.1 
 
 		 764 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  26.38 
 
 		 580 aa  128  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  26.01 
 
 		 547 aa  120  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  33.69 
 
 		 711 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2169  type II and III secretion system protein  25.49 
 
 		 792 aa  118  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.29218  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  25.47 
 
 		 682 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  23.68 
 
 		 685 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  27.27 
 
 		 864 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  25.84 
 
 		 944 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  25.49 
 
 		 874 aa  114  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  24.55 
 
 		 882 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  24.55 
 
 		 887 aa  114  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  24.55 
 
 		 887 aa  113  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  26.65 
 
 		 698 aa  113  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  26.65 
 
 		 698 aa  113  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  23.74 
 
 		 692 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  25.47 
 
 		 704 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  26.46 
 
 		 926 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  24.52 
 
 		 718 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  22.76 
 
 		 891 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  22.06 
 
 		 412 aa  112  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  25.24 
 
 		 894 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  22.06 
 
 		 412 aa  112  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  23.5 
 
 		 1421 aa  112  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  24.69 
 
 		 870 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3768  outer membrane porin HofQ  21.81 
 
 		 412 aa  111  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000640301  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  25.25 
 
 		 689 aa  111  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  25.35 
 
 		 756 aa  110  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  22.06 
 
 		 412 aa  110  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  22.42 
 
 		 578 aa  110  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  24.03 
 
 		 893 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3804  outer membrane porin HofQ  24.92 
 
 		 413 aa  110  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0625572  normal  0.855535 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  27.95 
 
 		 716 aa  110  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  21.81 
 
 		 412 aa  109  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  23.91 
 
 		 684 aa  109  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  21.81 
 
 		 412 aa  109  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  23.08 
 
 		 717 aa  109  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  25.73 
 
 		 946 aa  108  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  28.18 
 
 		 660 aa  108  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  23.82 
 
 		 684 aa  108  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  21.81 
 
 		 433 aa  108  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  21.57 
 
 		 412 aa  107  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  29.58 
 
 		 733 aa  107  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  21.57 
 
 		 412 aa  107  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  23.82 
 
 		 684 aa  107  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  23.74 
 
 		 683 aa  106  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  24.17 
 
 		 682 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  27.17 
 
 		 640 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  22.99 
 
 		 684 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  22.46 
 
 		 426 aa  106  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0322  outer membrane porin HofQ  22.45 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal  0.175294 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  24.47 
 
 		 683 aa  105  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  25.3 
 
 		 688 aa  105  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  25.61 
 
 		 696 aa  105  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3794  outer membrane porin HofQ  24.83 
 
 		 426 aa  105  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  27.84 
 
 		 640 aa  104  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  24.35 
 
 		 987 aa  104  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  23.57 
 
 		 718 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3760  outer membrane porin HofQ  24.5 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00726017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3687  outer membrane porin HofQ  24.83 
 
 		 389 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00260345  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  24.82 
 
 		 711 aa  103  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4606  putative outer membrane porin HofQ  23.7 
 
 		 413 aa  103  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000951162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  29.09 
 
 		 494 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  23.61 
 
 		 706 aa  103  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  23.5 
 
 		 682 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  24.53 
 
 		 683 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1043  type II and III secretion system protein  23.7 
 
 		 589 aa  102  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0150789  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  22.09 
 
 		 710 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  29.72 
 
 		 780 aa  102  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  28.36 
 
 		 655 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  24.06 
 
 		 683 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>