More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0977 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  41.69 
 
 		 1199 aa  725    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  39.63 
 
 		 1205 aa  642    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  41.13 
 
 		 1191 aa  696    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  38.06 
 
 		 1225 aa  636    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  40.92 
 
 		 1194 aa  692    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1172 aa  2362    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  48.01 
 
 		 1191 aa  421  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  69.52 
 
 		 1186 aa  422  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  30.71 
 
 		 1176 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  28.58 
 
 		 1185 aa  412  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  57.25 
 
 		 1198 aa  405  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  66.13 
 
 		 1188 aa  406  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  66.77 
 
 		 1203 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  43.28 
 
 		 1195 aa  403  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  66.56 
 
 		 1183 aa  399  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  62.34 
 
 		 1217 aa  399  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  66.13 
 
 		 1234 aa  395  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  58.82 
 
 		 1198 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  82.64 
 
 		 1213 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  62.74 
 
 		 1194 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  55.61 
 
 		 1224 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  73.62 
 
 		 1181 aa  385  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  62.46 
 
 		 1194 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  58.93 
 
 		 1194 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  58.02 
 
 		 1217 aa  380  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  60.75 
 
 		 1195 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  60.75 
 
 		 1195 aa  380  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  57.85 
 
 		 1188 aa  378  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  60.75 
 
 		 1195 aa  380  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  60.18 
 
 		 1263 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  75.85 
 
 		 1218 aa  376  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  61.39 
 
 		 1214 aa  361  6e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  26.94 
 
 		 1186 aa  348  2e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  56.31 
 
 		 1222 aa  337  7.999999999999999e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  39.04 
 
 		 1188 aa  336  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  23.87 
 
 		 1180 aa  330  1.0000000000000001e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  52.34 
 
 		 1227 aa  322  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  52.65 
 
 		 1191 aa  321  6e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  43.27 
 
 		 1222 aa  300  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  32.71 
 
 		 1190 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  35.65 
 
 		 1179 aa  278  4e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  55.56 
 
 		 1174 aa  273  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  54.46 
 
 		 1185 aa  269  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  31.11 
 
 		 1190 aa  268  5.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  53.81 
 
 		 1186 aa  261  4e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  52.8 
 
 		 1185 aa  260  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  45.08 
 
 		 1190 aa  258  6e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  52.34 
 
 		 1185 aa  257  8e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  39.15 
 
 		 1184 aa  257  1.0000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  32.36 
 
 		 1187 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  31.03 
 
 		 1191 aa  254  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  30 
 
 		 1196 aa  253  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  54.84 
 
 		 1177 aa  253  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  33.85 
 
 		 1184 aa  252  3e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  55.87 
 
 		 1187 aa  251  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  54.93 
 
 		 1189 aa  251  8e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  32.21 
 
 		 1187 aa  250  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  54.46 
 
 		 1189 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  54.46 
 
 		 1189 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  53.99 
 
 		 1189 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  53.99 
 
 		 1189 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  53.99 
 
 		 1189 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  54.46 
 
 		 1189 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  53.99 
 
 		 1189 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  53.99 
 
 		 1189 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  51.38 
 
 		 1186 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  53.99 
 
 		 1189 aa  246  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  53 
 
 		 1176 aa  245  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  53.99 
 
 		 1189 aa  246  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  50.43 
 
 		 1198 aa  244  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  29.54 
 
 		 1177 aa  243  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  29.81 
 
 		 1188 aa  243  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  29.81 
 
 		 1188 aa  243  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  51.87 
 
 		 1174 aa  243  1e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  39.68 
 
 		 1179 aa  243  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  54.41 
 
 		 1187 aa  239  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  53 
 
 		 1176 aa  239  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  53 
 
 		 1176 aa  239  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  45.28 
 
 		 1177 aa  234  6e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  50.47 
 
 		 1301 aa  231  7e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.75 
 
 		 1148 aa  230  1e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  42.61 
 
 		 1185 aa  230  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  50.93 
 
 		 1185 aa  229  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  48.36 
 
 		 1189 aa  226  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  51.43 
 
 		 1255 aa  222  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  44.48 
 
 		 1081 aa  221  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  39.86 
 
 		 980 aa  220  1e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  44.62 
 
 		 1204 aa  220  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  37.76 
 
 		 1178 aa  217  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  43.92 
 
 		 1199 aa  215  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  28.05 
 
 		 1172 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  42.42 
 
 		 1191 aa  215  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  43.81 
 
 		 1175 aa  213  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  46.95 
 
 		 1186 aa  213  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  28.65 
 
 		 1173 aa  207  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  41.01 
 
 		 1163 aa  205  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  42.32 
 
 		 1171 aa  204  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  42.63 
 
 		 1162 aa  199  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  42.99 
 
 		 1176 aa  197  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  44.84 
 
 		 1171 aa  197  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>