166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3307 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3307  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 461 aa  948    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1254  Extracellular ligand-binding receptor  51.22 
 
 		 474 aa  421  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1321  Extracellular ligand-binding receptor  33.48 
 
 		 444 aa  206  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1815  extracellular ligand-binding receptor  31.02 
 
 		 419 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2965  extracellular ligand-binding receptor  31.12 
 
 		 413 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.820015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3808  Extracellular ligand-binding receptor  31.26 
 
 		 434 aa  182  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0482  extracellular ligand-binding receptor  30.27 
 
 		 412 aa  180  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4089  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  29.34 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1322  extracellular ligand-binding receptor  29.2 
 
 		 418 aa  176  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0679703  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4759  extracellular ligand-binding receptor  30.21 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1941  Extracellular ligand-binding receptor  28.83 
 
 		 416 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0064  Extracellular ligand-binding receptor  30.21 
 
 		 421 aa  170  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4762  extracellular ligand-binding receptor  29.75 
 
 		 424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.78314 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  27.43 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  21.64 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5696  extracellular ligand-binding receptor  22.54 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668558  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  22.53 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.39 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  21.26 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2993  hypothetical protein  22.75 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0229  Extracellular ligand-binding receptor  24.88 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00108704  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  22.54 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0326  extracellular ligand-binding receptor  21.36 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.933316  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  21.14 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  24.59 
 
 		 414 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6648  Extracellular ligand-binding receptor  21.88 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0122953  normal  0.152 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5695  Extracellular ligand-binding receptor  22.97 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0211011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  23.78 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2316  extracellular ligand-binding receptor  23.69 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  22.49 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4060  extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  23.58 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  23.32 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0126  extracellular ligand-binding receptor  20.96 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2114  extracellular ligand-binding receptor  24.74 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0375175  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  24.38 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  22.79 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  22.9 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0052  Extracellular ligand-binding receptor  22.11 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1310  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  21 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381196  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  23.58 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  20.8 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3558  Extracellular ligand-binding receptor  20.72 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.987899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  25.79 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  20.93 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  22.4 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  22.77 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  20.18 
 
 		 375 aa  55.8  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0089  Extracellular ligand-binding receptor  25.3 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3322  twin-arginine translocation pathway signal  30.83 
 
 		 423 aa  55.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4064  extracellular ligand-binding receptor  18.75 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00184477  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1450  Extracellular ligand-binding receptor  20.24 
 
 		 415 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  22.99 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1288  extracellular ligand-binding receptor  20.24 
 
 		 415 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6073  Extracellular ligand-binding receptor  23.5 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0070  extracellular ligand-binding receptor  25.3 
 
 		 396 aa  55.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  23.57 
 
 		 339 aa  54.7  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  26.22 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  21.47 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1749  ABC transporter substrate-binding protein  35.95 
 
 		 442 aa  53.9  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.239653  normal  0.31899 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5900  extracellular ligand-binding receptor  22.22 
 
 		 384 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.137338 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  21.79 
 
 		 376 aa  53.9  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2173  branched chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  31.95 
 
 		 455 aa  53.5  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.473102  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  23.61 
 
 		 399 aa  53.5  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.34 
 
 		 406 aa  53.5  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1908  extracellular ligand-binding receptor  21.76 
 
 		 403 aa  53.1  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0299  extracellular ligand-binding receptor  23.1 
 
 		 403 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102439  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.04 
 
 		 406 aa  53.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1675  Extracellular ligand-binding receptor  21.49 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0898959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  23.45 
 
 		 402 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3706  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.02 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0806  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein  25.66 
 
 		 162 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.743706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0363  extracellular ligand-binding receptor  23.5 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  21.56 
 
 		 386 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0915  Extracellular ligand-binding receptor  22.76 
 
 		 405 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2712  extracellular ligand-binding receptor  20.85 
 
 		 405 aa  51.6  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.620726  hitchhiker  0.00485368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19650  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid binding protein  23.68 
 
 		 373 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337564  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1830  Extracellular ligand-binding receptor  19.79 
 
 		 375 aa  51.6  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290342  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  25.26 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2423  Extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0867221 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0392  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.25 
 
 		 403 aa  50.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224611  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0182  Extracellular ligand-binding receptor  20.61 
 
 		 401 aa  50.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  20.6 
 
 		 425 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  18.81 
 
 		 415 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  23.46 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2894  Extracellular ligand-binding receptor  24.38 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  28.03 
 
 		 412 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0612  extracellular ligand-binding receptor  24.01 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4013  extracellular ligand-binding receptor  24.09 
 
 		 391 aa  49.7  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00118971  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1478  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  21.16 
 
 		 380 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1663  extracellular ligand-binding receptor  19.69 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.596073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  23.11 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4434  extracellular ligand-binding receptor  22.78 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.45 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4994  extracellular ligand-binding receptor  21.37 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.539292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  21.15 
 
 		 380 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>