More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1675 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1675  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
387 aa  791    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0898959 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2330  Extracellular ligand-binding receptor  84.02 
 
 
386 aa  670    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0514  extracellular ligand-binding receptor  30.15 
 
 
409 aa  194  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0806  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein  48.32 
 
 
162 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.743706  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 
397 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.45 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  27.09 
 
 
402 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.56 
 
 
383 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  25.28 
 
 
383 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  25.28 
 
 
383 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  26.55 
 
 
410 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.98 
 
 
406 aa  104  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.98 
 
 
406 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.03 
 
 
396 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  24.81 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5857  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
411 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101493  normal  0.03083 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  29.2 
 
 
373 aa  97.1  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  25.86 
 
 
397 aa  97.1  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0326  extracellular ligand-binding receptor  24.42 
 
 
441 aa  97.1  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.933316  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1941  Extracellular ligand-binding receptor  23.77 
 
 
416 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  28.3 
 
 
339 aa  96.3  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  27.03 
 
 
380 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.2 
 
 
375 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.2 
 
 
379 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  28.2 
 
 
379 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  28.2 
 
 
379 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  28.7 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  28.7 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  28.7 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  22.25 
 
 
394 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  28.03 
 
 
382 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  27.43 
 
 
382 aa  93.2  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.2 
 
 
379 aa  93.2  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1288  extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 
415 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166473  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1450  Extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 
415 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.63 
 
 
381 aa  92  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  27.76 
 
 
419 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  26.3 
 
 
401 aa  92  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  27.99 
 
 
379 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  25.15 
 
 
370 aa  91.3  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  24.36 
 
 
415 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4465  extracellular ligand-binding receptor  25.77 
 
 
406 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.662069  normal  0.481724 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.7 
 
 
379 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  27.99 
 
 
379 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  27.9 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  27.99 
 
 
379 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 
379 aa  90.5  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  27.99 
 
 
379 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  27.99 
 
 
379 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  24.92 
 
 
370 aa  90.5  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.55 
 
 
376 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3558  Extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 
415 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.987899  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  28.36 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2140  extracellular ligand-binding receptor  24.36 
 
 
407 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0906  extracellular ligand-binding receptor  25.72 
 
 
439 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  25.3 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0664  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.51 
 
 
402 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  26.14 
 
 
376 aa  87  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0154  extracellular ligand-binding receptor  25.19 
 
 
395 aa  87  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2810  extracellular ligand-binding receptor  26.88 
 
 
377 aa  87  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.079562  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5995  putative leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  24.33 
 
 
407 aa  86.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524183  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  27.74 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4064  extracellular ligand-binding receptor  23.97 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00184477  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4333  Extracellular ligand-binding receptor  23.48 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  25.66 
 
 
417 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0172  Extracellular ligand-binding receptor  25.19 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0221424  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  26.03 
 
 
382 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1815  extracellular ligand-binding receptor  26.29 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00146471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0126  extracellular ligand-binding receptor  25.81 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3836  extracellular ligand-binding receptor  27.88 
 
 
410 aa  84.3  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.335848  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  27.02 
 
 
376 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.49 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  26.88 
 
 
383 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  26.98 
 
 
378 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1749  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  25.21 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  25.66 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1967  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  25.21 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000097926 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  27.09 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1792  branched-chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  25.21 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1931  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  25.21 
 
 
395 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1766  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  25.94 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4759  extracellular ligand-binding receptor  23.75 
 
 
421 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2126  extracellular ligand-binding receptor  25.24 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0857  extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 
411 aa  82.8  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4089  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  23.56 
 
 
428 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0064  Extracellular ligand-binding receptor  24.75 
 
 
421 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2268  extracellular ligand-binding receptor  23.74 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0458822  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  26.65 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2010  branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein, putative  25.21 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  26.38 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.88 
 
 
404 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  27.94 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3411  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  24.73 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000582907 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1931  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  25.21 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2031  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  25.21 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0138904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1801  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
405 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  24.18 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  27.33 
 
 
386 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1098  Extracellular ligand-binding receptor  24.21 
 
 
416 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0210365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>