More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0806 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0806  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein  100 
 
 		 162 aa  325  1.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.743706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1675  Extracellular ligand-binding receptor  50 
 
 		 387 aa  138  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0898959 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2330  Extracellular ligand-binding receptor  50.34 
 
 		 386 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0514  extracellular ligand-binding receptor  40.28 
 
 		 409 aa  101  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  45.37 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  38.38 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  37.4 
 
 		 390 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  42.48 
 
 		 382 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  37.23 
 
 		 417 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  34.29 
 
 		 395 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1376  extracellular ligand-binding receptor  35.14 
 
 		 415 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.416271  normal  0.0984666 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  39.37 
 
 		 339 aa  74.7  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  36 
 
 		 397 aa  74.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  33.12 
 
 		 396 aa  73.9  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  39.34 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1052  extracellular ligand-binding receptor  41.76 
 
 		 417 aa  72  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6587  Extracellular ligand-binding receptor  35.34 
 
 		 388 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.78 
 
 		 376 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  35.81 
 
 		 396 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5696  extracellular ligand-binding receptor  41.18 
 
 		 382 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668558  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  35.81 
 
 		 396 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  38.2 
 
 		 382 aa  70.5  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3460  extracellular ligand-binding receptor  39.13 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.403632  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  38.64 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  35.38 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6489  extracellular ligand-binding receptor  33.83 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225285  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  33.64 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  35.42 
 
 		 384 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1045  twin-arginine translocation pathway signal  42.39 
 
 		 407 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  42.86 
 
 		 399 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0114  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 383 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  40.43 
 
 		 386 aa  67.8  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 379 aa  67.8  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4465  extracellular ligand-binding receptor  34.38 
 
 		 406 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.662069  normal  0.481724 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  32.2 
 
 		 389 aa  67.4  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4443  extracellular ligand-binding receptor  40 
 
 		 413 aa  67.4  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1826  extracellular ligand-binding receptor  33.56 
 
 		 416 aa  67  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2303  extracellular ligand-binding receptor  42.67 
 
 		 432 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.620777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  35.04 
 
 		 387 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  44.14 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3767  Extracellular ligand-binding receptor  35.65 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  41.11 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.51 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  35.65 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0942  twin-arginine translocation pathway signal  39.13 
 
 		 407 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0664  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.56 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4333  Extracellular ligand-binding receptor  39.62 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2830  Extracellular ligand-binding receptor  35.29 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.345866 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  40.57 
 
 		 397 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  36.76 
 
 		 388 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  41.9 
 
 		 397 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  40.57 
 
 		 397 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6254  putative urea/short-chain binding protein  37.89 
 
 		 369 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172457  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  29.2 
 
 		 373 aa  65.1  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1976  extracellular ligand-binding receptor  34.17 
 
 		 406 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0906  extracellular ligand-binding receptor  40 
 
 		 439 aa  64.7  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3303  extracellular ligand-binding receptor  37.31 
 
 		 393 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3099  Extracellular ligand-binding receptor  35.29 
 
 		 367 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  34.58 
 
 		 376 aa  64.3  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0861  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.81 
 
 		 401 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00284433  normal  0.49325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4060  extracellular ligand-binding receptor  34.78 
 
 		 400 aa  64.3  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0612  extracellular ligand-binding receptor  36.17 
 
 		 412 aa  64.3  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0482  extracellular ligand-binding receptor  34.13 
 
 		 412 aa  63.9  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0004  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 417 aa  64.3  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000538672 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6014  extracellular ligand-binding receptor  32.33 
 
 		 387 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769519 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1255  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.71 
 
 		 415 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  32.29 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  32.33 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2641  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.2 
 
 		 1118 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.604832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  33.88 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  38.14 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  34.17 
 
 		 432 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  38.37 
 
 		 386 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  41 
 
 		 400 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1706  extracellular ligand-binding receptor  30.94 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  36.79 
 
 		 374 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  34.95 
 
 		 400 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2007  urea ABC transporter, urea binding protein  39.39 
 
 		 405 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  40.74 
 
 		 375 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0991  extracellular ligand-binding receptor  38.39 
 
 		 380 aa  62.4  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  35.29 
 
 		 389 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  39.18 
 
 		 390 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2361  extracellular ligand-binding receptor  31.03 
 
 		 383 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00517611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2425  extracellular ligand-binding receptor  29.93 
 
 		 411 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1815  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 419 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146471 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  31.97 
 
 		 386 aa  62  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1241  Extracellular ligand-binding receptor  32.5 
 
 		 406 aa  62  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0126  extracellular ligand-binding receptor  33.02 
 
 		 402 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  36.04 
 
 		 395 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  35.9 
 
 		 392 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  35.82 
 
 		 388 aa  61.6  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  38.37 
 
 		 396 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  39.76 
 
 		 392 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2341  extracellular ligand-binding receptor  32.11 
 
 		 405 aa  61.6  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.840598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  35.45 
 
 		 393 aa  61.2  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  28.87 
 
 		 387 aa  61.2  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1544  extracellular ligand-binding receptor  38.67 
 
 		 428 aa  60.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2965  extracellular ligand-binding receptor  37.1 
 
 		 413 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.820015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0117  extracellular ligand-binding receptor  29.05 
 
 		 414 aa  60.5  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  42.86 
 
 		 399 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>