More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4060 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4060  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 400 aa  806    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3767  Extracellular ligand-binding receptor  72.22 
 
 		 397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  71.96 
 
 		 397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  37.77 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  36.43 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  35.26 
 
 		 390 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  35.79 
 
 		 396 aa  209  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  35.53 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  35.91 
 
 		 396 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3303  extracellular ligand-binding receptor  36.67 
 
 		 393 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03165  Extracellular ligand-binding receptor  33.51 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2647  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 397 aa  175  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  34.81 
 
 		 399 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0612  extracellular ligand-binding receptor  34.52 
 
 		 412 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  32.45 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  32.74 
 
 		 404 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4053  extracellular ligand-binding receptor  32.61 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3194  Extracellular ligand-binding receptor  32.84 
 
 		 415 aa  162  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0291  extracellular ligand-binding receptor  34.71 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3706  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.87 
 
 		 405 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0915  Extracellular ligand-binding receptor  32.87 
 
 		 405 aa  159  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  32.23 
 
 		 402 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0299  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1549  extracellular ligand-binding receptor  31.55 
 
 		 392 aa  156  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.000137786  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  32.53 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  33.91 
 
 		 400 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2179  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.84 
 
 		 410 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1699  Extracellular ligand-binding receptor  29.84 
 
 		 410 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.574188  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  32.55 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1770  Extracellular ligand-binding receptor  29.57 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.718343  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2712  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.620726  hitchhiker  0.00485368 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0070  extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0089  Extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0096  extracellular ligand-binding receptor  30.38 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.809601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 		 393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1682  extracellular ligand-binding receptor  28.11 
 
 		 410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000183641  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  28.75 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  29.68 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0150  extracellular ligand-binding receptor  29.53 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  29.89 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1848  extracellular ligand-binding receptor  28.74 
 
 		 389 aa  107  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0671771  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  28.3 
 
 		 381 aa  106  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  30.33 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  28.77 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  28.18 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  30.08 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 		 378 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  27.04 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0861  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.35 
 
 		 401 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00284433  normal  0.49325 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0480  Extracellular ligand-binding receptor  29.21 
 
 		 407 aa  103  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5431  extracellular ligand-binding receptor  28.98 
 
 		 372 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 		 382 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  29.91 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  28.87 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.11 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1650  extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.46 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5638  putative ABC transporter binding protein subunit  33.2 
 
 		 413 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64900  putative binding protein component of ABC transporter  33.2 
 
 		 374 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  31.08 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 		 368 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  26.28 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  28.36 
 
 		 379 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  30.88 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  28.4 
 
 		 384 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  31.08 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  31.08 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  31.08 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2392  extracellular ligand-binding receptor  28.39 
 
 		 372 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0457851 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  30.55 
 
 		 380 aa  99.8  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.68 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1785  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.53 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1720  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.53 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5696  extracellular ligand-binding receptor  27.82 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668558  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  30.63 
 
 		 379 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  28.44 
 
 		 374 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3679  extracellular ligand-binding receptor  28.4 
 
 		 407 aa  97.8  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26140  ABC trasporter substrate binding protein  31.03 
 
 		 371 aa  97.4  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025399  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 		 398 aa  97.1  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  27.74 
 
 		 379 aa  97.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2254  extracellular ligand-binding receptor  30.65 
 
 		 373 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.412845 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1695  extracellular ligand-binding receptor  27.73 
 
 		 381 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  26.48 
 
 		 396 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  30.23 
 
 		 380 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.62 
 
 		 395 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3686  extracellular ligand-binding receptor  30.67 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  29.51 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1117  extracellular ligand-binding receptor  28.79 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000089327  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  29.47 
 
 		 371 aa  94.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  27.33 
 
 		 408 aa  94.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2361  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 		 383 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00517611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  28.96 
 
 		 376 aa  94  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>