More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6348 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  40.02 
 
 		 1048 aa  807    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1121 aa  2239    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  40.21 
 
 		 1063 aa  814    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.23 
 
 		 1054 aa  660    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.9 
 
 		 1060 aa  649    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.32 
 
 		 1074 aa  657    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  38.77 
 
 		 1075 aa  675    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.62 
 
 		 1041 aa  784    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.67 
 
 		 1067 aa  805    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  40.11 
 
 		 1063 aa  813    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  39.37 
 
 		 1053 aa  765    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  40.21 
 
 		 1063 aa  815    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  46.46 
 
 		 1052 aa  907    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  35.49 
 
 		 1057 aa  685    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  40.97 
 
 		 1044 aa  800    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  40.21 
 
 		 1063 aa  814    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  46.62 
 
 		 1038 aa  871    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  40.15 
 
 		 1039 aa  759    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.26 
 
 		 1093 aa  641    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  41.28 
 
 		 1042 aa  802    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  36.59 
 
 		 1060 aa  696    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  38.88 
 
 		 1055 aa  776    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  35.23 
 
 		 1069 aa  645    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  48.99 
 
 		 1032 aa  943    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  40.04 
 
 		 1067 aa  809    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  39.69 
 
 		 1063 aa  812    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  36.01 
 
 		 1060 aa  662    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  39.85 
 
 		 1067 aa  807    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  38.76 
 
 		 1050 aa  776    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  39.52 
 
 		 1049 aa  767    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  36.42 
 
 		 1061 aa  676    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  42.72 
 
 		 1051 aa  782    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  40.23 
 
 		 1067 aa  811    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  44.76 
 
 		 1034 aa  803    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  35.77 
 
 		 1073 aa  692    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.92 
 
 		 1067 aa  795    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  35.58 
 
 		 1060 aa  694    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  35.17 
 
 		 1056 aa  622  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  35.44 
 
 		 1068 aa  625  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  33.87 
 
 		 1053 aa  617  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  33.62 
 
 		 1052 aa  610  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  34.51 
 
 		 1062 aa  600  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  33.91 
 
 		 1050 aa  602  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  35.72 
 
 		 1074 aa  594  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  35.92 
 
 		 1072 aa  585  1.0000000000000001e-165  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  33.7 
 
 		 1053 aa  580  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  32.66 
 
 		 1054 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  33.78 
 
 		 1050 aa  568  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  34.35 
 
 		 1098 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  35.49 
 
 		 1043 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  34.49 
 
 		 1040 aa  558  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  32.62 
 
 		 1033 aa  556  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  33.56 
 
 		 1071 aa  550  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  33.24 
 
 		 1048 aa  548  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1048 aa  549  1e-154  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  35.29 
 
 		 1041 aa  547  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  32.37 
 
 		 1033 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  35.41 
 
 		 1053 aa  539  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 		 1054 aa  537  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  34.04 
 
 		 1064 aa  539  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 		 1041 aa  538  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1033 aa  526  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  31.33 
 
 		 1034 aa  526  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  31.44 
 
 		 1035 aa  524  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  31.29 
 
 		 1041 aa  520  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  31.96 
 
 		 1066 aa  520  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  31.65 
 
 		 1036 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  29.77 
 
 		 1030 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  29.63 
 
 		 1053 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 		 1063 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  29.53 
 
 		 1035 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  29.96 
 
 		 1030 aa  421  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  29.63 
 
 		 1035 aa  419  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  28.44 
 
 		 1043 aa  400  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 		 1131 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  26.46 
 
 		 1143 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  27.55 
 
 		 1092 aa  381  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  28.04 
 
 		 1043 aa  380  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  27.53 
 
 		 1034 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  25.93 
 
 		 1191 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  30.86 
 
 		 1135 aa  372  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  26.96 
 
 		 1050 aa  372  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1044 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  27.28 
 
 		 1055 aa  361  5e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1137 aa  360  6e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  25.85 
 
 		 1059 aa  357  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1038 aa  355  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  25.95 
 
 		 1146 aa  355  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  28.13 
 
 		 1043 aa  351  5e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1041 aa  349  2e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  26.43 
 
 		 1134 aa  348  4e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  25.57 
 
 		 1063 aa  346  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1993  acriflavin resistance protein  27.95 
 
 		 1025 aa  345  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 		 1034 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  26.41 
 
 		 1011 aa  344  5e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.36 
 
 		 1044 aa  340  7e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  24.71 
 
 		 1058 aa  339  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  27.07 
 
 		 1036 aa  337  7.999999999999999e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  24.52 
 
 		 1050 aa  335  2e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1034 aa  335  4e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>