87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0118 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  100 
 
 		 691 aa  1400    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  28.84 
 
 		 649 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.74 
 
 		 546 aa  133  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  27.27 
 
 		 593 aa  124  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  26.51 
 
 		 556 aa  121  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  29.12 
 
 		 569 aa  121  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  28.67 
 
 		 604 aa  119  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  30.91 
 
 		 604 aa  114  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.01 
 
 		 574 aa  114  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.26 
 
 		 600 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  28.28 
 
 		 583 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  25.94 
 
 		 573 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.41 
 
 		 1246 aa  102  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.89 
 
 		 1228 aa  100  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.32 
 
 		 596 aa  98.6  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.38 
 
 		 1225 aa  97.1  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.5 
 
 		 1208 aa  96.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.42 
 
 		 1226 aa  97.1  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  26.32 
 
 		 1120 aa  95.5  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.49 
 
 		 1193 aa  93.2  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.21 
 
 		 1192 aa  92.8  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.32 
 
 		 551 aa  91.3  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.77 
 
 		 1114 aa  90.5  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  29.49 
 
 		 1098 aa  90.1  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  24.57 
 
 		 593 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.56 
 
 		 1066 aa  87.4  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.05 
 
 		 1170 aa  86.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  25.96 
 
 		 577 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  25.99 
 
 		 585 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 1127 aa  84.7  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.37 
 
 		 737 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.34 
 
 		 1189 aa  82.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  26.91 
 
 		 1183 aa  81.3  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  29.32 
 
 		 562 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.57 
 
 		 1236 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  26.67 
 
 		 1107 aa  79  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  23.93 
 
 		 1113 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  28.99 
 
 		 803 aa  78.2  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  28.92 
 
 		 1088 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  28.21 
 
 		 499 aa  75.1  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  28.01 
 
 		 1129 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1575 aa  73.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  26.87 
 
 		 1109 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  28.79 
 
 		 574 aa  72  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  27.99 
 
 		 1127 aa  71.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  26.46 
 
 		 1166 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  27.47 
 
 		 1161 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.46 
 
 		 585 aa  67.8  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  26.25 
 
 		 1098 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  27.07 
 
 		 951 aa  65.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  26.51 
 
 		 1126 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 1184 aa  63.9  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  24.52 
 
 		 521 aa  61.6  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  25.38 
 
 		 1208 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  27.35 
 
 		 554 aa  58.2  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.05 
 
 		 1126 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  23.25 
 
 		 645 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  26.74 
 
 		 1203 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  40 
 
 		 878 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  25.35 
 
 		 655 aa  55.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  25.2 
 
 		 730 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  27.27 
 
 		 517 aa  54.3  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  22.06 
 
 		 685 aa  54.3  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  22.06 
 
 		 685 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.62 
 
 		 677 aa  53.9  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  23.98 
 
 		 1838 aa  53.9  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  22.88 
 
 		 872 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  24.08 
 
 		 658 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.19 
 
 		 453 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  26.04 
 
 		 566 aa  52.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  29.59 
 
 		 590 aa  51.6  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  23.34 
 
 		 681 aa  51.2  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.86 
 
 		 638 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  41.03 
 
 		 492 aa  48.5  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  25.98 
 
 		 1275 aa  48.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  27.31 
 
 		 895 aa  47  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  27.25 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  27.05 
 
 		 768 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  37.93 
 
 		 566 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  29.47 
 
 		 8871 aa  46.2  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.94 
 
 		 655 aa  45.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  26.17 
 
 		 404 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  25.4 
 
 		 3197 aa  45.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.37 
 
 		 11716 aa  44.7  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  25.61 
 
 		 1019 aa  44.3  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  31.01 
 
 		 616 aa  44.3  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  24 
 
 		 3197 aa  43.9  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>