More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0665 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  43.65 
 
 		 1022 aa  778    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 1051 aa  2125    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  38.96 
 
 		 1032 aa  722    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  37.48 
 
 		 1063 aa  649    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  43.21 
 
 		 1135 aa  782    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  48.63 
 
 		 1142 aa  942    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  48.38 
 
 		 1153 aa  944    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  51.75 
 
 		 1147 aa  1019    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  36.33 
 
 		 1138 aa  628  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  36.3 
 
 		 1033 aa  606  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 1165 aa  598  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  36.83 
 
 		 1036 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  37.32 
 
 		 1073 aa  577  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  35.46 
 
 		 1028 aa  556  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  36.08 
 
 		 1038 aa  558  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  35.27 
 
 		 1059 aa  537  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  34.45 
 
 		 1043 aa  534  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  34.31 
 
 		 1058 aa  534  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  34.1 
 
 		 1105 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  34.39 
 
 		 1093 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1067 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  33.06 
 
 		 1065 aa  494  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1065 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  33.93 
 
 		 1051 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 1033 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1031 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 		 1043 aa  482  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1074 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1063 aa  462  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  32.78 
 
 		 1038 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 		 1129 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  32.39 
 
 		 1010 aa  449  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1059 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1040 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 1169 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1127 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 1166 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 		 1081 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  31.36 
 
 		 1071 aa  428  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 1059 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 1098 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 1234 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 1081 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 1087 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1041 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 		 1186 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1102 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1163 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 1078 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  31.58 
 
 		 1083 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1071 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1137 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1064 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1047 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1008 aa  375  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1115 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 1050 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1011 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 1071 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1189 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1068 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 1107 aa  363  8e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1088 aa  362  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1072 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1099 aa  361  5e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 1073 aa  360  6e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1081 aa  355  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 1153 aa  351  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 		 1098 aa  347  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 1101 aa  346  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 1138 aa  338  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1044 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 1176 aa  318  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1088 aa  308  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  27.39 
 
 		 1025 aa  307  6e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 1039 aa  304  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1116 aa  300  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1057 aa  289  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1027 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 1084 aa  284  7.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 1037 aa  245  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 1014 aa  241  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 		 1129 aa  241  6.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 986 aa  239  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 1066 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 1023 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  26.33 
 
 		 962 aa  236  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 1051 aa  232  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 986 aa  231  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1177 aa  230  8e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 		 1096 aa  231  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 1038 aa  229  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 1117 aa  228  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  24 
 
 		 1105 aa  227  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  24.7 
 
 		 1155 aa  223  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 982 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 1080 aa  222  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 1046 aa  222  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  26.4 
 
 		 1116 aa  221  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 1076 aa  221  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>