More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0892 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00801  predicted diguanylate cyclase  99.1 
 
 		 442 aa  896    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2808  diguanylate cyclase  99.1 
 
 		 442 aa  896    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.415535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0985  diguanylate cyclase  99.27 
 
 		 413 aa  842    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.399371 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0905  diguanylate cyclase  98.87 
 
 		 442 aa  897    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00818  hypothetical protein  99.1 
 
 		 442 aa  896    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0892  diguanylate cyclase  100 
 
 		 442 aa  904    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.701109  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2810  diguanylate cyclase  100 
 
 		 442 aa  904    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0859  diguanylate cyclase  98.28 
 
 		 408 aa  826    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3494  diguanylate cyclase  36.53 
 
 		 384 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.316612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2380  GGDEF family protein  31.86 
 
 		 413 aa  95.5  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0242852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3991  diguanylate cyclase  34.48 
 
 		 396 aa  92.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6137  diguanylate cyclase  36.08 
 
 		 551 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11555  normal  0.0857113 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0266  diguanylate cyclase  36.77 
 
 		 1195 aa  90.1  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4678  GGDEF  33.51 
 
 		 432 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0820  GGDEF domain-containing protein  33.95 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1733  diguanylate cyclase  37.34 
 
 		 568 aa  89.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0602531  normal  0.409385 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1780  diguanylate cyclase  36.88 
 
 		 334 aa  88.6  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4051  diguanylate cyclase  38.55 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0769882  normal  0.0972661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1980  diguanylate cyclase  35.71 
 
 		 334 aa  89  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3609  diguanylate cyclase  35.9 
 
 		 328 aa  87.8  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.407775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1338  diguanylate cyclase  35 
 
 		 469 aa  87  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0898942  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2179  diguanylate cyclase  40.38 
 
 		 477 aa  87  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000210421  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3423  GGDEF domain-containing protein  33.96 
 
 		 325 aa  86.7  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2643  diguanylate cyclase  34.18 
 
 		 470 aa  86.7  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1006  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.59 
 
 		 312 aa  86.3  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  32.77 
 
 		 578 aa  86.3  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2632  GGDEF domain-containing protein  33.33 
 
 		 411 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4164  diguanylate cyclase  32.35 
 
 		 384 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4207  GGDEF domain-containing protein  34.38 
 
 		 625 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2151  hypothetical protein  32.98 
 
 		 296 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6549  diguanylate cyclase  32.91 
 
 		 546 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1703  diguanylate cyclase  26.25 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00246889  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2479  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.13 
 
 		 531 aa  86.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838154  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1509  diguanylate cyclase  34.32 
 
 		 835 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0192657  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0397  diguanylate cyclase  34.38 
 
 		 625 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3733  diguanylate cyclase  34.38 
 
 		 625 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2983  diguanylate cyclase  34.64 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4104  diguanylate cyclase  33.74 
 
 		 610 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.147884 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3559  diguanylate cyclase  34.38 
 
 		 625 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0453  GGDEF domain-containing protein  34.78 
 
 		 641 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3943  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.14 
 
 		 761 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000940136 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02778  GGDEF protein  34.38 
 
 		 946 aa  84  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0052  response regulator protein  33.13 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.189873  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1270  diguanylate cyclase  31.76 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2197  GGDEF family protein  34.12 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0437  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  33.74 
 
 		 628 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0211155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4784  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.53 
 
 		 785 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000123  GGDEF domain protein  33.33 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.608204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2110  diguanylate cyclase  32.46 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000973231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2123  hypothetical protein  32.46 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0850031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4153  putative sensory box/GGDEF family protein  34.39 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36181  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  34.76 
 
 		 650 aa  83.6  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1289  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1744  hypothetical protein  32.46 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00489018  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0294  diguanylate cyclase  33.52 
 
 		 504 aa  83.6  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0077  diguanylate cyclase  34.12 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.978885  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1837  diguanylate cyclase  36.81 
 
 		 544 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.980403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1557  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.36 
 
 		 741 aa  83.6  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814898 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0493  GGDEF family protein  34.86 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0380455  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1845  diguanylate cyclase  35.29 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3966  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000335389 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0020  diguanylate cyclase  36.59 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1085  putative sensory box/GGDEF family protein  34.39 
 
 		 430 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3903  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  34.38 
 
 		 628 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3873  diguanylate cyclase  34.39 
 
 		 430 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1536  diguanylate cyclase  31.67 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370191  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3452  GGDEF domain-containing protein  33.14 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0967  GGDEF family protein  32.72 
 
 		 976 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1127  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2446  diguanylate cyclase  35.29 
 
 		 341 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0209282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0736  diguanylate cyclase  30.61 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000330305  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000797  GGDEF family protein  31.71 
 
 		 337 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1629  hypothetical protein  32.46 
 
 		 296 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2485  diguanylate cyclase  34.15 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3373  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.92 
 
 		 666 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3669  diguanylate cyclase  38.41 
 
 		 300 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0596  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.97 
 
 		 474 aa  82.8  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000817529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0423  diguanylate cyclase  34.38 
 
 		 621 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679734 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1803  diguanylate cyclase  31.62 
 
 		 519 aa  82  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00715144  normal  0.974304 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06694  hypothetical protein  29.46 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2508  diguanylate cyclase  33.91 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0196  diguanylate cyclase  31.14 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0411  diguanylate cyclase  34.78 
 
 		 628 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02517  hypothetical protein  38.22 
 
 		 537 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2062  diguanylate cyclase  30.08 
 
 		 620 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.502085 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2459  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.16 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.685644  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4400  diguanylate cyclase  33.54 
 
 		 681 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.118889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2703  diguanylate cyclase  32.56 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4428  diguanylate cyclase  30.25 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2514  diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.39605  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1523  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.12 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.02 
 
 		 1264 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2408  diguanylate cyclase  32.14 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0498  diguanylate cyclase  32.7 
 
 		 624 aa  82  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0325  diguanylate cyclase  32.98 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.320199  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003556  GGDEF family protein  41.29 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000111859  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1831  diguanylate cyclase  35.29 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0533362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1879  diguanylate cyclase  34.71 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3083  diguanylate cyclase  31.61 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1757  GGDEF domain-containing protein  34.57 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.463116  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  34.68 
 
 		 554 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>