More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0266 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0266  diguanylate cyclase  100 
 
 		 1195 aa  2394    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1528  diguanylate cyclase  30.41 
 
 		 1339 aa  318  5e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.646539  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0267  diguanylate cyclase  26.79 
 
 		 1320 aa  230  1e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1257  TPR repeat-containing diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase  24.72 
 
 		 1203 aa  214  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  43.75 
 
 		 425 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12380  diguanylate cyclase  41.81 
 
 		 499 aa  124  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00534046  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2867  diguanylate cyclase  38.92 
 
 		 402 aa  122  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3474  diguanylate cyclase  43.4 
 
 		 393 aa  122  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0624369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6549  diguanylate cyclase  41.25 
 
 		 546 aa  122  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0457  diguanylate cyclase  42.68 
 
 		 349 aa  121  9e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0512  response regulator PleD  41.57 
 
 		 456 aa  120  9.999999999999999e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1019  diguanylate cyclase  38.17 
 
 		 351 aa  121  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4604  diguanylate cyclase  42.59 
 
 		 489 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3550  diguanylate cyclase  34.82 
 
 		 559 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953301  normal  0.354246 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.94 
 
 		 550 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0050  putative diguanylate cyclase  40.85 
 
 		 696 aa  119  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315879  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0269  diguanylate cyclase  38.99 
 
 		 485 aa  119  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.853723  hitchhiker  0.00000177476 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6137  diguanylate cyclase  42.48 
 
 		 551 aa  119  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11555  normal  0.0857113 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4457  GGDEF domain-containing protein  38.99 
 
 		 485 aa  118  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  42.5 
 
 		 418 aa  118  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0621  diguanylate cyclase  39.39 
 
 		 323 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0613  diguanylate cyclase  41.82 
 
 		 611 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  40 
 
 		 457 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0489  diguanylate cyclase  37.93 
 
 		 384 aa  117  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1511  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.07 
 
 		 557 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00005186  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0021  diguanylate cyclase  39.51 
 
 		 423 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3362  diguanylate cyclase  40.72 
 
 		 380 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.57 
 
 		 415 aa  117  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0034  diguanylate cyclase  41.83 
 
 		 433 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523887  normal  0.941955 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2527  diguanylate cyclase  39.63 
 
 		 381 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0313  diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 577 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3711  diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 571 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.171778 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000814  hypothetical protein  35.76 
 
 		 402 aa  116  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0596  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.77 
 
 		 474 aa  116  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000817529  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1198  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 971 aa  116  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1366  diguanylate cyclase  40.12 
 
 		 369 aa  115  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7005  GGDEF family protein  37.57 
 
 		 568 aa  116  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1123  diguanylate cyclase  38.32 
 
 		 357 aa  115  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0998424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2679  diguanylate cyclase  38.55 
 
 		 459 aa  116  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0109  diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 461 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0272  diguanylate cyclase  39.62 
 
 		 486 aa  115  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0276  diguanylate cyclase  39.62 
 
 		 486 aa  115  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0280  diguanylate cyclase  39.62 
 
 		 486 aa  115  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3762  diguanylate cyclase  40.25 
 
 		 368 aa  115  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742847  normal  0.824996 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  41.03 
 
 		 560 aa  115  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  30.34 
 
 		 578 aa  115  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0410  diguanylate cyclase  40 
 
 		 657 aa  115  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754716 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0486  diguanylate cyclase  34.2 
 
 		 738 aa  115  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0308  diguanylate cyclase  37.78 
 
 		 581 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164957 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1880  diguanylate cyclase  39.87 
 
 		 477 aa  114  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0268707  normal  0.0491745 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1872  diguanylate cyclase  38.1 
 
 		 586 aa  114  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10295  normal  0.872274 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2153  membrane associated GGDEF protein  39.75 
 
 		 490 aa  114  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.24 
 
 		 505 aa  114  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3753  diguanylate cyclase  37.74 
 
 		 485 aa  114  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.580016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2109  diguanylate cyclase  40.36 
 
 		 630 aa  114  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2179  diguanylate cyclase  40 
 
 		 477 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000210421  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0841  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.24 
 
 		 715 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2422  diguanylate cyclase  37.79 
 
 		 532 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1646  diguanylate cyclase  42.33 
 
 		 580 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000165959  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0279  diguanylate cyclase  38.99 
 
 		 486 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00774453  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2207  diguanylate cyclase  37.24 
 
 		 735 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0268  diguanylate cyclase  39.38 
 
 		 485 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.624982  hitchhiker  0.000186113 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1536  diguanylate cyclase  40.24 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370191  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0129  GGDEF domain-containing protein  38.41 
 
 		 645 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1477  diguanylate cyclase  38.61 
 
 		 411 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0266  GGDEF  40.24 
 
 		 690 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.8 
 
 		 797 aa  114  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2449  GGDEF domain-containing protein  37.95 
 
 		 498 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2607  diguanylate cyclase  36.92 
 
 		 316 aa  113  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000143356  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  39.38 
 
 		 517 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0146  diguanylate cyclase  38.41 
 
 		 645 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0144  diguanylate cyclase  38.41 
 
 		 642 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21320  diguanylate cyclase  41.82 
 
 		 510 aa  113  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0809  hypothetical protein  41.98 
 
 		 516 aa  112  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3330  diguanylate cyclase  40.62 
 
 		 556 aa  112  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1851  diguanylate cyclase  38.95 
 
 		 620 aa  112  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  38.1 
 
 		 650 aa  112  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1036  diguanylate cyclase  44.16 
 
 		 427 aa  112  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0413  diguanylate cyclase  36.31 
 
 		 373 aa  112  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0124  diguanylate cyclase  42.24 
 
 		 492 aa  112  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00884448  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1927  diguanylate cyclase  41.52 
 
 		 340 aa  113  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0449945  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.17 
 
 		 454 aa  112  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1323  diguanylate cyclase  37.17 
 
 		 350 aa  112  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134516  normal  0.420197 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1382  response regulator receiver protein  42.17 
 
 		 302 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0330  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.8 
 
 		 531 aa  112  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2979  diguanylate cyclase  41.46 
 
 		 490 aa  112  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0802  diguanylate cyclase  41.36 
 
 		 321 aa  112  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0820  GGDEF domain-containing protein  36.17 
 
 		 333 aa  111  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2050  diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 523 aa  111  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645943 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  40.49 
 
 		 457 aa  111  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.68 
 
 		 450 aa  111  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000908772  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1476  diguanylate cyclase  40.96 
 
 		 414 aa  111  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.64785  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0782  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.68 
 
 		 450 aa  111  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000969424  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0689  putative diguanylate cyclase  35.96 
 
 		 306 aa  111  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3218  diguanylate cyclase  38.99 
 
 		 532 aa  111  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0332  DNA polymerase III delta prime subunit HolB  41.1 
 
 		 349 aa  111  8.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3973  hypothetical protein  36.17 
 
 		 355 aa  111  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6679  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.16 
 
 		 457 aa  111  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3430  diguanylate cyclase  37.2 
 
 		 513 aa  111  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.89 
 
 		 355 aa  111  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000595067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>