More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4941 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1039 aa  2120    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  34.07 
 
 		 1078 aa  552  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 1050 aa  541  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  35.21 
 
 		 1044 aa  535  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 1059 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  33.93 
 
 		 1047 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 1065 aa  462  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  32.04 
 
 		 1101 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  33.49 
 
 		 1028 aa  455  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  32.27 
 
 		 1064 aa  455  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  31.83 
 
 		 1011 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1038 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 1105 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1189 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  33.09 
 
 		 1081 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1051 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 1093 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1040 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 1073 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1071 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 1088 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 		 1135 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1138 aa  423  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  30.72 
 
 		 1065 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 1038 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 1129 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 1031 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 1043 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1063 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 1027 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1022 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1068 aa  415  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1165 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1059 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 		 1033 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  29.67 
 
 		 1071 aa  402  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1074 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  30.34 
 
 		 1087 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  29.62 
 
 		 1058 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1081 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1127 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1059 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1153 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 1166 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 1063 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1071 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  29.27 
 
 		 1032 aa  365  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 1234 aa  365  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1169 aa  363  6e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 1033 aa  363  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1072 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 1098 aa  362  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 1142 aa  357  6.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1036 aa  355  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1073 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 1115 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1043 aa  352  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  27.56 
 
 		 1010 aa  350  9e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1088 aa  348  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 1081 aa  347  5e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  28.81 
 
 		 1138 aa  342  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  28.83 
 
 		 1083 aa  338  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1186 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 1147 aa  330  7e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1153 aa  327  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 1098 aa  325  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 1176 aa  325  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 1041 aa  325  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  28.16 
 
 		 1025 aa  325  4e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 1107 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1057 aa  322  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1040 aa  321  5e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 1099 aa  319  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 1137 aa  317  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 1008 aa  316  1.9999999999999998e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1046 aa  315  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 		 1084 aa  310  8e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 1163 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1161 aa  308  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1067 aa  298  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1023 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 1043 aa  293  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  28.45 
 
 		 1051 aa  290  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 994 aa  277  6e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 1010 aa  277  9e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 		 999 aa  276  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 1116 aa  276  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 1038 aa  273  9e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 982 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 1029 aa  272  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6126  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 986 aa  273  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 996 aa  270  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 1047 aa  270  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1021 aa  270  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  25.35 
 
 		 986 aa  270  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  26.48 
 
 		 1019 aa  269  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 1128 aa  269  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  26.84 
 
 		 1035 aa  268  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 1027 aa  266  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  27.37 
 
 		 1024 aa  265  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>