More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3426 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  100 
 
 		 434 aa  815    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  43.69 
 
 		 438 aa  311  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  44.72 
 
 		 434 aa  289  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  46.1 
 
 		 466 aa  288  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  42.99 
 
 		 439 aa  275  8e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  43.37 
 
 		 436 aa  272  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  44.1 
 
 		 441 aa  270  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  46.59 
 
 		 448 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  41.39 
 
 		 451 aa  260  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  43.26 
 
 		 465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  44.2 
 
 		 442 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  45.71 
 
 		 441 aa  248  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  42.24 
 
 		 442 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  42.76 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  42.76 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  42.76 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  41.22 
 
 		 449 aa  244  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  47.3 
 
 		 427 aa  240  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  46.03 
 
 		 442 aa  239  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  43.26 
 
 		 442 aa  239  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  39.73 
 
 		 467 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  47.21 
 
 		 459 aa  232  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  43.93 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  42.99 
 
 		 460 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  44.5 
 
 		 450 aa  224  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  40.97 
 
 		 434 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  40.78 
 
 		 446 aa  217  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  43.93 
 
 		 442 aa  217  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  44.29 
 
 		 437 aa  210  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  42.7 
 
 		 458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  41.38 
 
 		 470 aa  199  9e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  41.29 
 
 		 470 aa  194  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  37.44 
 
 		 481 aa  190  4e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  35.6 
 
 		 453 aa  182  7e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  35.11 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  38.36 
 
 		 455 aa  161  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 475 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  28.33 
 
 		 445 aa  156  7e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 461 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  31.62 
 
 		 446 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  34.29 
 
 		 445 aa  139  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  31.95 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  32.31 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 447 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  31.55 
 
 		 441 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  29.55 
 
 		 467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  33.63 
 
 		 492 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3501  DNA-damage-inducible protein F  29.89 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  26.35 
 
 		 449 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  29.04 
 
 		 455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  32.05 
 
 		 448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 436 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  27.95 
 
 		 447 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  34.43 
 
 		 460 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  27.66 
 
 		 495 aa  126  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  28.12 
 
 		 484 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  27.89 
 
 		 547 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 495 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  30.77 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 469 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  27.89 
 
 		 547 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  27.89 
 
 		 546 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  29.26 
 
 		 443 aa  123  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  27.93 
 
 		 423 aa  123  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  28.28 
 
 		 484 aa  122  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  27.44 
 
 		 546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  30.52 
 
 		 468 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  28.39 
 
 		 456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1292  multi anti extrusion protein MatE  34.48 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0439  MATE efflux family protein  31.28 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  23.79 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  30.22 
 
 		 560 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4849  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 450 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3772  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 450 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 456 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 455 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 455 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 455 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2844  MATE efflux family protein  34.64 
 
 		 455 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.94035  normal  0.605375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  29.68 
 
 		 462 aa  116  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  30.18 
 
 		 466 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  29.41 
 
 		 436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  29.19 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  32.48 
 
 		 456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1840  MATE efflux family protein  29.53 
 
 		 458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308247  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0025  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 433 aa  113  8.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00700816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  28.8 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  30.65 
 
 		 459 aa  111  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  28.57 
 
 		 477 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  28.57 
 
 		 477 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  25.3 
 
 		 469 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04000  Na(+) driven multidrug efflux pump  28.57 
 
 		 424 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  31.78 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0107  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  27.67 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 445 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  28.57 
 
 		 476 aa  109  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1296  MATE efflux family protein  34.41 
 
 		 459 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.16 
 
 		 464 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>