125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4876 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4876  PKD domain containing protein  100 
 
 		 313 aa  648    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  normal  0.596683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4102  PKD domain containing protein  33.97 
 
 		 295 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.774924  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3280  PKD domain-containing protein  30 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  32.41 
 
 		 1094 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  31.58 
 
 		 1606 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  31.91 
 
 		 1095 aa  63.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  31.03 
 
 		 1528 aa  62.8  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  30.77 
 
 		 679 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  30.77 
 
 		 685 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  32.58 
 
 		 669 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  29.01 
 
 		 859 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  30.08 
 
 		 675 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  31.82 
 
 		 910 aa  60.5  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  31.06 
 
 		 658 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  28.99 
 
 		 547 aa  59.7  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  28.12 
 
 		 735 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  29.32 
 
 		 1292 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  30.23 
 
 		 2122 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  30.53 
 
 		 978 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  30.83 
 
 		 1682 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  30.18 
 
 		 752 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  29.69 
 
 		 823 aa  57  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  28.12 
 
 		 581 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  30.32 
 
 		 941 aa  56.6  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  33.98 
 
 		 644 aa  56.6  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  32.81 
 
 		 816 aa  56.2  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  29.77 
 
 		 1842 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  31.13 
 
 		 561 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  27.7 
 
 		 1732 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  29.69 
 
 		 713 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  31.54 
 
 		 551 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  27.46 
 
 		 791 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  26.92 
 
 		 816 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  29.6 
 
 		 840 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  29.45 
 
 		 684 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  31.01 
 
 		 930 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  29.05 
 
 		 2272 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  27.7 
 
 		 3295 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  28.95 
 
 		 786 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1667 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  29.25 
 
 		 1783 aa  53.1  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  30.41 
 
 		 1300 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  29.77 
 
 		 963 aa  53.1  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  29.85 
 
 		 1882 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  29.92 
 
 		 1969 aa  52.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  29.01 
 
 		 1862 aa  52.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  27.27 
 
 		 1057 aa  52.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  29.32 
 
 		 1241 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  28.35 
 
 		 971 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  28.67 
 
 		 771 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  30.15 
 
 		 575 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  27.91 
 
 		 918 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  29.46 
 
 		 777 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  29.13 
 
 		 845 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  31.54 
 
 		 870 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  29.46 
 
 		 861 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  28.8 
 
 		 1236 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  28.57 
 
 		 1011 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  30.07 
 
 		 1565 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  29.19 
 
 		 819 aa  50.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  31.94 
 
 		 1667 aa  50.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  28.8 
 
 		 2036 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  28.67 
 
 		 2000 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  28.89 
 
 		 1361 aa  50.1  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  28.36 
 
 		 460 aa  50.1  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  28.36 
 
 		 2176 aa  49.3  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  31.71 
 
 		 2554 aa  49.3  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  28.65 
 
 		 1120 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  39.58 
 
 		 586 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  29.57 
 
 		 1814 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  22.29 
 
 		 1162 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  30.16 
 
 		 528 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  30.77 
 
 		 802 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2499  PKD  45.65 
 
 		 374 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00083014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  40.74 
 
 		 938 aa  47  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1001 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  29.1 
 
 		 2552 aa  47  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  25.5 
 
 		 615 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  26.92 
 
 		 1371 aa  46.2  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  29.41 
 
 		 184 aa  46.2  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  32.5 
 
 		 2066 aa  45.8  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  28.81 
 
 		 865 aa  45.8  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  27.2 
 
 		 1602 aa  45.8  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  31.07 
 
 		 560 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  29.55 
 
 		 517 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  44 
 
 		 965 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  30.14 
 
 		 930 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  26.61 
 
 		 719 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  54.29 
 
 		 971 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  54.29 
 
 		 971 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4174  PKD domain containing protein  30.77 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0180807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1282 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  48.72 
 
 		 1311 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  54.29 
 
 		 971 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  29.2 
 
 		 1231 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  31.3 
 
 		 936 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  31.3 
 
 		 936 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  27.03 
 
 		 650 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  54.29 
 
 		 971 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  26.71 
 
 		 552 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>