More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2204 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 845 aa  1724    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  55.9 
 
 		 807 aa  907    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  62.8 
 
 		 828 aa  1057    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  65.65 
 
 		 836 aa  1158    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  67.75 
 
 		 815 aa  1096    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  59.6 
 
 		 828 aa  1041    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 742 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 737 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 762 aa  137  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  34.66 
 
 		 747 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.09 
 
 		 653 aa  122  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  20.75 
 
 		 714 aa  115  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 763 aa  111  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 709 aa  110  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 760 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  23.84 
 
 		 795 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 		 748 aa  107  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 764 aa  106  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  35.53 
 
 		 1147 aa  104  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  29.1 
 
 		 833 aa  103  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 690 aa  103  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  25 
 
 		 656 aa  100  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 654 aa  98.6  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 798 aa  98.6  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  35.39 
 
 		 1066 aa  97.4  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 1075 aa  97.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  31.43 
 
 		 776 aa  97.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  23.9 
 
 		 681 aa  97.4  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.11 
 
 		 859 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 1004 aa  96.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 778 aa  96.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  27.31 
 
 		 750 aa  95.1  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 772 aa  94.4  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  26.39 
 
 		 782 aa  93.6  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 759 aa  94  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  22.86 
 
 		 780 aa  93.6  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 742 aa  93.2  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  22.56 
 
 		 812 aa  93.2  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  25.53 
 
 		 848 aa  92.4  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 769 aa  92.4  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  22.15 
 
 		 663 aa  91.7  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 683 aa  92  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  23.07 
 
 		 692 aa  91.7  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  32.04 
 
 		 791 aa  91.3  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 783 aa  90.9  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  26.94 
 
 		 799 aa  90.5  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 833 aa  90.9  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  22.92 
 
 		 673 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  23.97 
 
 		 722 aa  89.7  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 782 aa  89  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 736 aa  89.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 866 aa  89.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 753 aa  89  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 757 aa  89  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 678 aa  88.6  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 753 aa  87.8  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  28.85 
 
 		 795 aa  87.4  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  21.07 
 
 		 679 aa  87.4  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  21.46 
 
 		 697 aa  87.4  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 767 aa  87  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 882 aa  87  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 744 aa  87  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  24.63 
 
 		 857 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.05 
 
 		 728 aa  86.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 686 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  22.59 
 
 		 727 aa  86.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 861 aa  85.9  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 		 809 aa  85.9  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  21.78 
 
 		 666 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 971 aa  85.1  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  21.81 
 
 		 708 aa  84.7  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 1071 aa  84.7  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 		 710 aa  84.7  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 917 aa  84.7  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 920 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  22.35 
 
 		 663 aa  84  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 988 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 757 aa  83.6  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 888 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  24.91 
 
 		 807 aa  83.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  22.94 
 
 		 646 aa  82.4  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 1089 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 761 aa  82.8  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 1001 aa  82.4  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  21.26 
 
 		 666 aa  82  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 783 aa  82  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 893 aa  82  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 789 aa  81.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 1101 aa  82  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  21.26 
 
 		 666 aa  82  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 		 1006 aa  81.6  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  27.54 
 
 		 617 aa  81.6  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 785 aa  81.3  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  21.26 
 
 		 666 aa  81.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 1041 aa  80.9  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  21.57 
 
 		 639 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  21.26 
 
 		 666 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  24.16 
 
 		 659 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 1087 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  23.88 
 
 		 663 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>