More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2713 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  100 
 
 		 838 aa  1621    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.37 
 
 		 742 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  42.22 
 
 		 814 aa  412  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  39.94 
 
 		 806 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  38.45 
 
 		 946 aa  353  5.9999999999999994e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  38.59 
 
 		 928 aa  351  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  37.65 
 
 		 921 aa  349  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  39.29 
 
 		 965 aa  348  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  37.82 
 
 		 930 aa  337  3.9999999999999995e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  37.39 
 
 		 907 aa  324  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  37.57 
 
 		 993 aa  309  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 757 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  36.67 
 
 		 970 aa  303  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  34.28 
 
 		 919 aa  292  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  37.39 
 
 		 908 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  44.1 
 
 		 915 aa  290  9e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  35.98 
 
 		 1020 aa  288  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  36.83 
 
 		 928 aa  278  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 775 aa  271  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  35.31 
 
 		 967 aa  267  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  37.96 
 
 		 931 aa  263  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  34.04 
 
 		 941 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  39.61 
 
 		 797 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4985  Tetratricopeptide TPR_4  37.52 
 
 		 687 aa  254  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.688243  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  34.27 
 
 		 788 aa  253  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  34.94 
 
 		 715 aa  251  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  34.15 
 
 		 790 aa  241  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 1071 aa  235  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  33.82 
 
 		 956 aa  234  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  36.04 
 
 		 1088 aa  224  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  33.38 
 
 		 1048 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  33.24 
 
 		 1025 aa  221  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  36.38 
 
 		 755 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  33.49 
 
 		 937 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  29.93 
 
 		 1027 aa  217  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  38.94 
 
 		 1030 aa  214  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  41.13 
 
 		 1014 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  30.4 
 
 		 913 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  31.52 
 
 		 996 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  32.54 
 
 		 1011 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.44 
 
 		 921 aa  207  6e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  33.18 
 
 		 1004 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  36.62 
 
 		 1054 aa  206  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  37.1 
 
 		 978 aa  204  7e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 850 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  33.88 
 
 		 770 aa  201  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  33.86 
 
 		 1017 aa  198  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  31.72 
 
 		 995 aa  198  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  36.85 
 
 		 690 aa  197  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  31.97 
 
 		 981 aa  196  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  32.81 
 
 		 741 aa  193  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  33.52 
 
 		 993 aa  192  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  37.45 
 
 		 1008 aa  192  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  34.01 
 
 		 965 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  37.85 
 
 		 1033 aa  190  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  37.63 
 
 		 1010 aa  188  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  38.31 
 
 		 990 aa  188  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  31.81 
 
 		 940 aa  187  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  41.5 
 
 		 1001 aa  187  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  35.26 
 
 		 792 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2767  hypothetical protein  32.93 
 
 		 715 aa  186  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0532773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  31.54 
 
 		 1034 aa  184  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  31.34 
 
 		 964 aa  184  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  31.52 
 
 		 783 aa  184  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  32.78 
 
 		 1003 aa  181  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  37.96 
 
 		 935 aa  181  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  33.8 
 
 		 1013 aa  180  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  34.58 
 
 		 992 aa  179  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  35.14 
 
 		 982 aa  178  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  32.72 
 
 		 962 aa  177  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  33.65 
 
 		 981 aa  177  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  37.92 
 
 		 989 aa  176  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  29.47 
 
 		 1022 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  29.62 
 
 		 992 aa  173  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  38.53 
 
 		 1003 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  37.67 
 
 		 632 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 1003 aa  172  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  31.92 
 
 		 954 aa  171  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5351  hypothetical protein  34.81 
 
 		 862 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  36.52 
 
 		 1108 aa  169  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0225  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 792 aa  168  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  40.06 
 
 		 810 aa  167  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  34.32 
 
 		 1138 aa  167  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  36.77 
 
 		 990 aa  164  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34600  putative transcriptional regulator  32.45 
 
 		 896 aa  162  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.240739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 934 aa  161  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  37.75 
 
 		 1030 aa  159  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 907 aa  158  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  36.99 
 
 		 775 aa  157  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  32.5 
 
 		 941 aa  154  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  36.78 
 
 		 910 aa  154  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  38.86 
 
 		 1024 aa  153  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  30.3 
 
 		 1022 aa  150  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  34.74 
 
 		 983 aa  150  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  35.58 
 
 		 782 aa  149  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  38.44 
 
 		 926 aa  148  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1805  putative regulator protein  32.96 
 
 		 708 aa  146  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  30.13 
 
 		 827 aa  145  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  36 
 
 		 963 aa  144  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  31.78 
 
 		 680 aa  144  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>