242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3340 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3340  phage integrase family protein  100 
 
 		 452 aa  909    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.58116  normal  0.0453376 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3461  integrase family protein  55.43 
 
 		 435 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  47.26 
 
 		 457 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  47.26 
 
 		 457 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0094  Phage integrase  43.98 
 
 		 449 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000297047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0686  integrase family protein  44.13 
 
 		 472 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2717  Phage integrase  44.57 
 
 		 479 aa  362  8e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3805  integrase family protein  51.54 
 
 		 450 aa  362  9e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  44.57 
 
 		 441 aa  353  4e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1526  phage integrase  40.72 
 
 		 440 aa  295  9e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  30.04 
 
 		 424 aa  144  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  28.01 
 
 		 406 aa  140  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  26.73 
 
 		 417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  25.55 
 
 		 413 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  26.44 
 
 		 403 aa  95.9  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  24.8 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  26.13 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  27.18 
 
 		 410 aa  87  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  31.25 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  25 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  22.9 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  24.37 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  26.32 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  24.01 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  26.85 
 
 		 452 aa  73.2  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  25.19 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  24.88 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  22.64 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  30.57 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  24.21 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  22.75 
 
 		 423 aa  67  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  23.08 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  20.5 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  23.53 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  24.88 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  23.1 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2770  integrase family protein  26.42 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00484712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  23.25 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  22.39 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  22.63 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  27.8 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  24.92 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  29.45 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3028  putative phage integrase family protein  24.36 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  25.74 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2956  integrase family protein  24.22 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  23.81 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  23.87 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  29.28 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  23.06 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  24.64 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  28.25 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  30.32 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  28.24 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  24 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  22.53 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  28.72 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  26.06 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  23.25 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  25.24 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  25.56 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  23.39 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  21.35 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  22.54 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  36.09 
 
 		 353 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  23.28 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2541  putative CP4-like integrase  29.81 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  26.54 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  31.51 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  32.89 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  28.57 
 
 		 343 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  25.3 
 
 		 450 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  23.15 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.7 
 
 		 359 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  29.29 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  24 
 
 		 459 aa  55.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  27.91 
 
 		 398 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  27.63 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  23.17 
 
 		 376 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  22.2 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  23.21 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  24.72 
 
 		 407 aa  55.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  25.49 
 
 		 429 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  20.49 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  27.15 
 
 		 159 aa  54.3  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  23.81 
 
 		 415 aa  54.7  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  26.49 
 
 		 407 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  26.35 
 
 		 338 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  23.72 
 
 		 425 aa  53.9  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  23.67 
 
 		 396 aa  54.3  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  22.42 
 
 		 415 aa  53.9  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  27.92 
 
 		 222 aa  53.9  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  25.28 
 
 		 391 aa  53.9  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  25.46 
 
 		 381 aa  53.9  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  22.44 
 
 		 400 aa  53.5  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0596  integrase family protein  23.85 
 
 		 515 aa  53.5  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  27.78 
 
 		 392 aa  53.5  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  24.51 
 
 		 421 aa  53.1  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  29.8 
 
 		 340 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  23.59 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>