More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1018 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 861 aa  1721    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  28.47 
 
 		 764 aa  210  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  26.96 
 
 		 905 aa  168  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  28.43 
 
 		 898 aa  148  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  26.01 
 
 		 808 aa  140  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.8 
 
 		 1051 aa  137  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  23.55 
 
 		 773 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  23.09 
 
 		 831 aa  118  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.52 
 
 		 807 aa  115  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  23.18 
 
 		 801 aa  114  9e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  21.95 
 
 		 755 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  24.11 
 
 		 789 aa  112  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  21.5 
 
 		 779 aa  112  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  22.34 
 
 		 806 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  23.83 
 
 		 763 aa  107  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.94 
 
 		 837 aa  107  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  24.04 
 
 		 385 aa  107  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  24.17 
 
 		 385 aa  106  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  20.36 
 
 		 877 aa  105  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  23.27 
 
 		 385 aa  105  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  23.31 
 
 		 788 aa  105  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  24.61 
 
 		 380 aa  102  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  23.94 
 
 		 804 aa  100  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  29.12 
 
 		 767 aa  100  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  24.73 
 
 		 860 aa  98.2  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  22.49 
 
 		 388 aa  97.8  7e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  22.73 
 
 		 886 aa  95.9  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  24.37 
 
 		 815 aa  94.7  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  36.13 
 
 		 821 aa  94.4  8e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  23 
 
 		 803 aa  94  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  25.31 
 
 		 778 aa  92.4  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  31.14 
 
 		 727 aa  92  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  24.86 
 
 		 865 aa  92  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  21.73 
 
 		 881 aa  92  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  21.81 
 
 		 756 aa  90.9  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  27.07 
 
 		 855 aa  90.9  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  26.09 
 
 		 862 aa  88.6  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  24.63 
 
 		 689 aa  88.2  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  23.3 
 
 		 387 aa  87.8  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  21.91 
 
 		 791 aa  87  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  23.38 
 
 		 694 aa  87  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  31.64 
 
 		 1131 aa  87  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  29.78 
 
 		 1011 aa  86.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  29.88 
 
 		 895 aa  86.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  30.6 
 
 		 1359 aa  85.5  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  20.08 
 
 		 779 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  33.11 
 
 		 859 aa  84  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  23.05 
 
 		 835 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  27.66 
 
 		 796 aa  82.8  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  19.73 
 
 		 800 aa  82.4  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  30.11 
 
 		 692 aa  82.8  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  23.42 
 
 		 790 aa  82  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  30 
 
 		 828 aa  81.3  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  32.7 
 
 		 807 aa  80.9  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  21.37 
 
 		 752 aa  80.5  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  24.09 
 
 		 821 aa  80.9  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  20.47 
 
 		 811 aa  80.5  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  22.22 
 
 		 792 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  31.76 
 
 		 1204 aa  79.3  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  19.92 
 
 		 778 aa  79.3  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  36.36 
 
 		 813 aa  79  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.73 
 
 		 872 aa  78.6  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  29.19 
 
 		 825 aa  77.4  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.99 
 
 		 1109 aa  77  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  30.97 
 
 		 815 aa  77.4  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  34.44 
 
 		 872 aa  77.4  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  24.09 
 
 		 752 aa  76.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  26.82 
 
 		 874 aa  76.3  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  27.39 
 
 		 792 aa  75.5  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  25.26 
 
 		 864 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  25.2 
 
 		 694 aa  74.7  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  22.72 
 
 		 808 aa  74.7  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  25.26 
 
 		 869 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  27.37 
 
 		 862 aa  73.9  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  29.8 
 
 		 800 aa  73.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  25.26 
 
 		 869 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  30.25 
 
 		 816 aa  73.2  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  27.8 
 
 		 845 aa  73.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  24.04 
 
 		 799 aa  73.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  26.25 
 
 		 797 aa  73.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  22.78 
 
 		 758 aa  73.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  23.24 
 
 		 812 aa  73.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  23.16 
 
 		 772 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  22.86 
 
 		 769 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  31.85 
 
 		 972 aa  72.8  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  19.78 
 
 		 751 aa  72.4  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0356  hypothetical protein  21.73 
 
 		 685 aa  72  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  28.82 
 
 		 849 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  25.08 
 
 		 755 aa  71.2  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  21.47 
 
 		 892 aa  70.9  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  20.38 
 
 		 1083 aa  70.5  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  27.39 
 
 		 842 aa  70.1  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  22.79 
 
 		 768 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  21.76 
 
 		 748 aa  69.7  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  21.99 
 
 		 794 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  23.4 
 
 		 830 aa  69.7  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  20.23 
 
 		 771 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0819  antibiotic ABC transporter, permease protein  23.37 
 
 		 695 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23648  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  21.36 
 
 		 765 aa  68.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  19.78 
 
 		 784 aa  68.9  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>