105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0007 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  65.64 
 
 		 913 aa  1194    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 		 911 aa  1872    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1588  HAD family hydrolase  35.61 
 
 		 835 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1229  PKD domain-containing protein  40.03 
 
 		 675 aa  446  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  35.93 
 
 		 469 aa  243  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04415  hypothetical protein  33.84 
 
 		 424 aa  231  5e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0155  hypothetical protein  33.26 
 
 		 538 aa  202  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.781085  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04410  hypothetical protein  29.16 
 
 		 501 aa  196  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07181  conserved hypothetical protein  29.22 
 
 		 452 aa  160  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882964  normal  0.428749 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.12 
 
 		 1283 aa  72  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3237  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.22 
 
 		 1512 aa  72  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  36.15 
 
 		 1107 aa  68.2  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.69 
 
 		 1292 aa  66.2  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  38.33 
 
 		 826 aa  64.3  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  29.41 
 
 		 2305 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  38.46 
 
 		 972 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3239  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.84 
 
 		 1535 aa  61.6  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  33.6 
 
 		 833 aa  60.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  29.07 
 
 		 1393 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  36.94 
 
 		 746 aa  60.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  30.58 
 
 		 2310 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3394  secreted protein  40.48 
 
 		 470 aa  60.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  42.86 
 
 		 2706 aa  59.7  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  30.26 
 
 		 1393 aa  59.3  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  29.3 
 
 		 1031 aa  58.5  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  32.21 
 
 		 1220 aa  58.2  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.41 
 
 		 1212 aa  57.4  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3395  secreted protein  25.13 
 
 		 458 aa  57.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.201979  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  33.09 
 
 		 1750 aa  57  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  37.27 
 
 		 8871 aa  57  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  29.63 
 
 		 1265 aa  57  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.5 
 
 		 3168 aa  56.6  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  38.1 
 
 		 1311 aa  56.2  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  28.57 
 
 		 1258 aa  55.1  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.96 
 
 		 1340 aa  54.7  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  39.18 
 
 		 868 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3393  putative secreted protein  28.32 
 
 		 471 aa  53.9  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327426  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  31.11 
 
 		 1215 aa  53.5  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.88 
 
 		 2194 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.36 
 
 		 1225 aa  53.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0423  hypothetical protein  39.76 
 
 		 809 aa  53.5  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  25 
 
 		 713 aa  53.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  37.11 
 
 		 450 aa  52.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.42 
 
 		 889 aa  52.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  30.65 
 
 		 3278 aa  52.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  35.24 
 
 		 985 aa  52.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  33.05 
 
 		 950 aa  52.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.37 
 
 		 1212 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.49 
 
 		 1800 aa  52.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.37 
 
 		 1212 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.37 
 
 		 1212 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  32.17 
 
 		 571 aa  52  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  33.33 
 
 		 848 aa  52  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.5 
 
 		 1212 aa  52  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.85 
 
 		 1222 aa  51.2  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1835  serine protease  31.58 
 
 		 660 aa  50.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  26.91 
 
 		 1037 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  30.63 
 
 		 750 aa  50.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  39.36 
 
 		 868 aa  50.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  37.11 
 
 		 868 aa  50.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  31.76 
 
 		 994 aa  50.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.7 
 
 		 1113 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  35 
 
 		 855 aa  49.7  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.29 
 
 		 469 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  31.68 
 
 		 656 aa  49.3  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2058  putative secreted protein  22.52 
 
 		 480 aa  49.3  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6147  putative secreted protein  44.26 
 
 		 450 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0413388 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1013  PKD domain-containing protein  35.26 
 
 		 842 aa  49.3  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000167268  normal  0.298358 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  28.69 
 
 		 932 aa  49.3  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25 
 
 		 1012 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0174  hypothetical protein  29.06 
 
 		 438 aa  48.9  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.023441  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  31.3 
 
 		 867 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  34.04 
 
 		 868 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  31.37 
 
 		 1035 aa  48.9  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  34.04 
 
 		 868 aa  48.9  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.92 
 
 		 693 aa  48.9  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000805587 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28 
 
 		 1286 aa  48.5  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4367  protease domain-containing protein  30.28 
 
 		 583 aa  48.5  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000129346  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  32.69 
 
 		 868 aa  48.5  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.7 
 
 		 1118 aa  48.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  35.11 
 
 		 863 aa  48.1  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  29 
 
 		 1011 aa  47.8  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  29.79 
 
 		 816 aa  47  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.94 
 
 		 1009 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.87 
 
 		 1399 aa  46.6  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  28.03 
 
 		 5171 aa  47  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.58 
 
 		 865 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1112  hypothetical protein  37.5 
 
 		 901 aa  46.2  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0403332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1180  hypothetical protein  41.56 
 
 		 902 aa  46.2  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.56 
 
 		 3396 aa  46.2  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.38 
 
 		 1661 aa  46.2  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  33.85 
 
 		 848 aa  45.8  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1396  putative secreted protein  35.38 
 
 		 460 aa  46.2  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3893  hypothetical protein  31.25 
 
 		 640 aa  45.8  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429721 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  32.97 
 
 		 1222 aa  45.4  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.33 
 
 		 647 aa  45.8  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00841  PKD domain protein  31.45 
 
 		 1098 aa  45.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.11 
 
 		 1217 aa  45.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0094  peptidase M6, immune inhibitor A  26.29 
 
 		 865 aa  45.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1395  putative secreted protein  37.5 
 
 		 486 aa  45.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>