More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27950 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  100 
 
 		 923 aa  1803    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  42.9 
 
 		 940 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  39.87 
 
 		 879 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  43.96 
 
 		 835 aa  388  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  36.32 
 
 		 995 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  35.14 
 
 		 917 aa  365  3e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  38.2 
 
 		 913 aa  361  4e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  34.57 
 
 		 919 aa  340  5.9999999999999996e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  34.64 
 
 		 911 aa  290  7e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  33.41 
 
 		 909 aa  290  9e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  32.23 
 
 		 928 aa  281  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  33.76 
 
 		 938 aa  258  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 		 904 aa  249  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  31.66 
 
 		 884 aa  241  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  31.57 
 
 		 920 aa  238  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 950 aa  225  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  32.31 
 
 		 940 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  31.36 
 
 		 928 aa  218  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  31.18 
 
 		 923 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  33.05 
 
 		 913 aa  213  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  31.97 
 
 		 918 aa  213  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  29.96 
 
 		 925 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  31.17 
 
 		 928 aa  208  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  32.03 
 
 		 894 aa  209  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  31.26 
 
 		 937 aa  208  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 937 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  31.47 
 
 		 937 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  31.52 
 
 		 913 aa  206  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  30.33 
 
 		 930 aa  206  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  31 
 
 		 919 aa  197  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 936 aa  191  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  28.51 
 
 		 903 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  28.11 
 
 		 905 aa  175  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  30.92 
 
 		 929 aa  172  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  30.12 
 
 		 923 aa  167  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  28.69 
 
 		 922 aa  165  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  29.67 
 
 		 934 aa  155  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  28.53 
 
 		 927 aa  143  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  27.36 
 
 		 919 aa  138  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 919 aa  138  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  27.46 
 
 		 919 aa  138  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  27.78 
 
 		 900 aa  131  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  34.57 
 
 		 927 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  33.27 
 
 		 929 aa  124  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  32.76 
 
 		 916 aa  123  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  35.65 
 
 		 961 aa  122  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 921 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  26.32 
 
 		 921 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  26.21 
 
 		 921 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  31.8 
 
 		 946 aa  118  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  27.26 
 
 		 919 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  27.41 
 
 		 893 aa  114  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  36.64 
 
 		 955 aa  110  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  35.28 
 
 		 910 aa  109  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  30.03 
 
 		 884 aa  107  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  34.45 
 
 		 923 aa  107  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  34.5 
 
 		 892 aa  106  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  34.85 
 
 		 915 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 889 aa  103  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  32.22 
 
 		 998 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  30.37 
 
 		 977 aa  102  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  33.23 
 
 		 953 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  34.44 
 
 		 240 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  42.52 
 
 		 894 aa  96.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 881 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 881 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 876 aa  92  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  37.59 
 
 		 189 aa  86.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  35.32 
 
 		 567 aa  85.5  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  39.18 
 
 		 951 aa  82.8  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  41.8 
 
 		 910 aa  82.8  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 1000 aa  81.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  30.29 
 
 		 959 aa  80.9  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  32.98 
 
 		 921 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  36.13 
 
 		 929 aa  78.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  34.6 
 
 		 574 aa  78.6  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 877 aa  77.8  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  33 
 
 		 997 aa  77.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 943 aa  76.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 1064 aa  75.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  40.83 
 
 		 927 aa  75.1  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 946 aa  70.5  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 236 aa  70.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 974 aa  70.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  32.16 
 
 		 973 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1927  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 535 aa  69.3  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  36.55 
 
 		 947 aa  67.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  38.83 
 
 		 953 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  49.21 
 
 		 896 aa  66.6  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 541 aa  66.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  40.2 
 
 		 963 aa  66.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  31.03 
 
 		 925 aa  65.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1485  transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 952 aa  65.1  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  34.07 
 
 		 916 aa  64.7  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 544 aa  64.7  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 956 aa  64.3  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  36.6 
 
 		 897 aa  64.3  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  36.96 
 
 		 947 aa  63.9  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 544 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  40.59 
 
 		 937 aa  64.3  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>