More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1167 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1167  regulatory protein TetR  100 
 
 		 220 aa  453  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000201787  n/a   
 
 
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NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  29.41 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  29.17 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 257 aa  71.6  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  30 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  26.47 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
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NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  25.13 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
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NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  31.86 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1558  transcriptional regulator, TetR family  36.15 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  31.43 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009707  JJD26997_1589  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
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NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  32.04 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
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NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  34.83 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
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NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  22.87 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
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NC_003912  CJE0417  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.582738  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  27.53 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0391  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.914065  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  27.84 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1641  transcriptional regulator, TetR family protein  32.37 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.216203  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  26.54 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 412 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 412 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 412 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  24.87 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  24.51 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 388 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  28.81 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  37.1 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  23.7 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  21.61 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
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NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
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NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
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NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 391 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
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NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  26.75 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_3406  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122321  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  30.68 
 
 		 226 aa  52  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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