More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4580 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0584  methyl-accepting chemotaxis transducer  86.5 
 
 		 647 aa  1102    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77697  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 648 aa  1315    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  73.92 
 
 		 646 aa  967    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  73.27 
 
 		 646 aa  956    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  80.09 
 
 		 648 aa  1033    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.5 
 
 		 647 aa  1102    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.494937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  87.58 
 
 		 647 aa  1090    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624074  hitchhiker  0.000681907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.61 
 
 		 655 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.51 
 
 		 671 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3100  chemotaxis sensory transducer  33.58 
 
 		 652 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.594551  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1081  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.26 
 
 		 629 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.95 
 
 		 630 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  30.43 
 
 		 630 aa  306  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.584827 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.36 
 
 		 630 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.36 
 
 		 630 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.36 
 
 		 630 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.2 
 
 		 630 aa  287  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  36.19 
 
 		 622 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.3 
 
 		 630 aa  277  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  31.6 
 
 		 623 aa  276  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.36 
 
 		 668 aa  273  7e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.481177  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  31.61 
 
 		 630 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  30.21 
 
 		 623 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.2 
 
 		 630 aa  272  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.04 
 
 		 630 aa  270  8e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.28 
 
 		 627 aa  266  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  35.62 
 
 		 627 aa  262  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.92 
 
 		 636 aa  261  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.59 
 
 		 630 aa  259  7e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  34.3 
 
 		 627 aa  259  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 		 630 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  33.45 
 
 		 626 aa  258  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2142  methyl-accepting chemotaxis protein  28.77 
 
 		 712 aa  257  4e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  33.94 
 
 		 628 aa  254  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 		 623 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.3 
 
 		 623 aa  253  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.52 
 
 		 626 aa  252  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.21 
 
 		 638 aa  253  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.3 
 
 		 623 aa  253  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  31.67 
 
 		 652 aa  253  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4557  methyl-accepting chemotaxis protein  33.27 
 
 		 623 aa  251  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  34.75 
 
 		 633 aa  252  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.86 
 
 		 628 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.46 
 
 		 645 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  34.5 
 
 		 643 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.84 
 
 		 638 aa  251  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  43.38 
 
 		 559 aa  250  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.68 
 
 		 628 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  32.72 
 
 		 629 aa  250  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.34 
 
 		 623 aa  250  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0596  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 		 640 aa  250  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.270432 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  32.78 
 
 		 629 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0252  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.87 
 
 		 623 aa  249  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.866394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1741  methyl-accepting chemotaxis protein  34.94 
 
 		 623 aa  249  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  32.97 
 
 		 629 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.9 
 
 		 697 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.71 
 
 		 554 aa  248  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.41 
 
 		 714 aa  248  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  32.97 
 
 		 629 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34 
 
 		 625 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  35.54 
 
 		 712 aa  247  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1022  methyl-accepting chemotaxis protein  32.41 
 
 		 628 aa  246  6.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.771007  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.46 
 
 		 638 aa  246  9e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.94 
 
 		 623 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  32.58 
 
 		 639 aa  246  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  32.77 
 
 		 645 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.4 
 
 		 645 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.78 
 
 		 636 aa  245  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00353653  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  34.9 
 
 		 712 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.84 
 
 		 645 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  37.35 
 
 		 714 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.68 
 
 		 645 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  33.4 
 
 		 626 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04784  histidine kinase  32.36 
 
 		 628 aa  243  6e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.03 
 
 		 643 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.98 
 
 		 636 aa  243  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  33.76 
 
 		 641 aa  242  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  33.09 
 
 		 626 aa  243  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.73 
 
 		 626 aa  243  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  44.07 
 
 		 714 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  33.58 
 
 		 713 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.8 
 
 		 632 aa  241  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.93 
 
 		 637 aa  242  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.12 
 
 		 626 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.98 
 
 		 640 aa  242  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.27 
 
 		 632 aa  242  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  35.46 
 
 		 639 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.36 
 
 		 627 aa  240  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.41 
 
 		 541 aa  240  5.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.49 
 
 		 688 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.85 
 
 		 623 aa  239  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.438395  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.17 
 
 		 541 aa  239  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4141  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.21 
 
 		 623 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.06 
 
 		 695 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0484461 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.54 
 
 		 674 aa  238  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  33.27 
 
 		 626 aa  238  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.97 
 
 		 624 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.69 
 
 		 623 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.69 
 
 		 623 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.74 
 
 		 560 aa  238  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>