277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0607 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 		 438 aa  883    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.22 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  33.18 
 
 		 457 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.71 
 
 		 424 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  27.03 
 
 		 456 aa  170  6e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  35.57 
 
 		 453 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  31.47 
 
 		 429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  29.5 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  28 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3653  type I restriction enzyme StySPI specificity protein  25 
 
 		 460 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234587  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.03 
 
 		 453 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  31.8 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5276  restriction modification system DNA specificity subunit  28.39 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  33.33 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  24.35 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.81 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  23.27 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  26.8 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  24.76 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  26.5 
 
 		 427 aa  114  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2086  restriction modification system DNA specificity domain protein  35.68 
 
 		 417 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000683293 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  23.73 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4007  restriction endonuclease S subunits-like  22.05 
 
 		 412 aa  111  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  29.17 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7555  Restriction endonuclease S subunits-like protein  21.38 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.96 
 
 		 429 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.74 
 
 		 422 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  24.03 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  33.94 
 
 		 520 aa  106  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1064  type I restriction-modification  24.05 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000898872  normal  0.027841 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0149  restriction modification system DNA specificity subunit  24.08 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1103  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.92 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0442932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  23.66 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  32.94 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  26.2 
 
 		 435 aa  103  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  26.01 
 
 		 420 aa  103  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.47 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3267  restriction modification system DNA specificity subunit  34.21 
 
 		 557 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0920403  decreased coverage  0.00535253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  28.21 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  25.9 
 
 		 426 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.2 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  36.08 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1061  putative type I restriction-modification system, S subunit  24.94 
 
 		 528 aa  100  7e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  24.71 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  26.56 
 
 		 438 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1778  type I restriction-modification system specificity subunit  23.65 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.926504  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1027  restriction modification system DNA specificity subunit  32.95 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.09 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  0.00000677276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  24.26 
 
 		 428 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.61 
 
 		 462 aa  97.4  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  35.71 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3540  restriction modification system DNA specificity subunit  29.11 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  21.72 
 
 		 549 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  24.94 
 
 		 426 aa  95.5  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2194  restriction modification system DNA specificity subunit  24.04 
 
 		 427 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.122675  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  24.6 
 
 		 477 aa  94  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.98 
 
 		 620 aa  94.4  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  23.31 
 
 		 430 aa  94  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  23.7 
 
 		 439 aa  92  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  24.63 
 
 		 374 aa  92  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1176  restriction modification system DNA specificity subunit  26.89 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.882603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  25.06 
 
 		 417 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  23.27 
 
 		 422 aa  91.3  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0841  type I restriction-modification system, S subunit  21.11 
 
 		 407 aa  90.9  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  31.55 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0789  type I restriction-modification system, S subunit  21.11 
 
 		 407 aa  90.5  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190219  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0944  restriction modification system DNA specificity subunit  23.72 
 
 		 420 aa  90.1  7e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000962716  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2909  restriction modification system DNA specificity subunit  20.59 
 
 		 440 aa  90.1  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  23.73 
 
 		 446 aa  89.7  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.69 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  25.15 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1978  restriction modification system DNA specificity subunit  26.78 
 
 		 616 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.16 
 
 		 423 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3425  restriction endonuclease S subunits-like  22.74 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835151  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2607  restriction modification system DNA specificity subunit  25.11 
 
 		 462 aa  88.2  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0023  type I restriction-modification system specificity subunit  23.73 
 
 		 411 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0031  type I restriction-modification system specificity subunit  23.73 
 
 		 411 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404176  normal  0.032892 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  27.37 
 
 		 433 aa  86.7  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  20.66 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  31.52 
 
 		 846 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  26.04 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3599  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.76 
 
 		 532 aa  84.7  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.743632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1566  restriction modification system DNA specificity subunit  27.66 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293394  unclonable  0.0000192379 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1095  hypothetical protein  21.94 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0429  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.88 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  22.39 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.78 
 
 		 565 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.49 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  22.46 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0564  restriction modification system DNA specificity subunit  27.64 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00017151  decreased coverage  6.20122e-17 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1954  restriction modification system DNA specificity subunit  30.77 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  23.25 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1502  restriction modification system DNA specificity domain  29.75 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0403  restriction modification system DNA specificity subunit  26.88 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  23.99 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.6 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  25 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0006  type I restriction-modification system, S subunit, EcoA family  25.3 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3499  restriction modification system DNA specificity subunit  23.73 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.082109 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  25.22 
 
 		 1343 aa  80.5  0.00000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>