100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4883 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4883  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
187 aa  374  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00152311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1545  hypothetical protein  62.16 
 
 
186 aa  240  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1163  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
189 aa  109  2e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370888  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5169  hypothetical protein  37.1 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27231  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 
200 aa  68.6  6e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
383 aa  67.4  1e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
202 aa  67  1e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
188 aa  65.1  5e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  29.82 
 
 
203 aa  63.9  1e-09  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 
193 aa  62.8  3e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 
192 aa  62.4  4e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
200 aa  62.4  4e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  4.43748e-06  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
200 aa  62.4  4e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
200 aa  62.4  4e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  8.27938e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
213 aa  61.6  6e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
225 aa  60.1  2e-08  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 
199 aa  60.1  2e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
210 aa  60.1  2e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
215 aa  59.7  3e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
204 aa  59.3  4e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 
191 aa  58.5  5e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 
204 aa  58.2  7e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  34.56 
 
 
219 aa  57.8  8e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 
206 aa  57.8  1e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  28.72 
 
 
204 aa  57  1e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 
208 aa  57.8  1e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 
205 aa  57  2e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 
228 aa  55.1  5e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 
209 aa  54.7  7e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 
208 aa  55.1  7e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 
201 aa  54.7  8e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 
206 aa  54.3  9e-07  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 
178 aa  54.3  1e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 
199 aa  53.9  1e-06  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  27.1 
 
 
266 aa  53.5  2e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 
194 aa  52.8  3e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 
206 aa  52.8  3e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
193 aa  53.1  3e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
205 aa  52.4  4e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 
199 aa  52.4  4e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  22.47 
 
 
210 aa  52  5e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  29.84 
 
 
202 aa  51.2  8e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
213 aa  50.8  1e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  27.98 
 
 
222 aa  50.8  1e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
197 aa  50.8  1e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
194 aa  50.8  1e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 
224 aa  50.8  1e-05  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
194 aa  50.8  1e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 
205 aa  49.7  2e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 
194 aa  49.7  2e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
237 aa  50.4  2e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  26.81 
 
 
198 aa  50.1  2e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  27.32 
 
 
224 aa  49.7  3e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
194 aa  49.3  3e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 
199 aa  48.9  4e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 
196 aa  48.5  5e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 
185 aa  48.5  5e-05  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 
203 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 
193 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
210 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  1.71234e-07  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  23.31 
 
 
191 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
234 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 
215 aa  45.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 
212 aa  45.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
231 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
191 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
191 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
191 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 
216 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 
216 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 
216 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 
222 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  28.47 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
188 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 
213 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 
223 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 
214 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  27.74 
 
 
204 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 
206 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 
187 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  29.71 
 
 
213 aa  42.4  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 
188 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  24.36 
 
 
202 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  26.32 
 
 
203 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  23.63 
 
 
202 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
213 aa  41.6  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  32.06 
 
 
188 aa  41.2  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 
230 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
213 aa  41.2  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 
248 aa  41.2  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  27.88 
 
 
211 aa  41.2  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
209 aa  41.2  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  21.23 
 
 
191 aa  41.2  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
200 aa  40.8  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>