88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03692 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  38.97 
 
 		 917 aa  635    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03692  TPR domain protein  100 
 
 		 924 aa  1870    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0309  TPR domain-containing protein  26.54 
 
 		 914 aa  265  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  25.8 
 
 		 917 aa  234  7.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  24.71 
 
 		 892 aa  217  8e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  24.36 
 
 		 918 aa  188  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  25.44 
 
 		 929 aa  171  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 934 aa  165  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  25.04 
 
 		 923 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 944 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 883 aa  121  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  22.17 
 
 		 955 aa  117  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  23.03 
 
 		 924 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 931 aa  108  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.87 
 
 		 935 aa  101  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.35 
 
 		 883 aa  101  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 900 aa  95.5  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 		 860 aa  94  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 927 aa  91.3  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 		 884 aa  87.8  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.17 
 
 		 884 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  22.65 
 
 		 864 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 		 952 aa  72.8  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.35 
 
 		 557 aa  70.5  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.61 
 
 		 882 aa  68.2  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.29 
 
 		 882 aa  66.6  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  20.52 
 
 		 886 aa  65.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1008  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000389173  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  21.35 
 
 		 1979 aa  62  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.93 
 
 		 582 aa  59.7  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  24.85 
 
 		 729 aa  58.5  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 886 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 873 aa  56.2  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.27 
 
 		 689 aa  55.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  23.4 
 
 		 603 aa  54.7  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0178  hypothetical protein  33.09 
 
 		 880 aa  54.7  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0441956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.04 
 
 		 924 aa  54.3  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.4 
 
 		 553 aa  54.3  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  21.63 
 
 		 1069 aa  53.5  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0423  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 880 aa  53.5  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0262641 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.87 
 
 		 563 aa  52.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01310  TPR domain protein  23.61 
 
 		 893 aa  52.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  24.54 
 
 		 931 aa  53.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2959  tetratricopeptide TPR_4  24.67 
 
 		 939 aa  52.4  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 		 448 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2297  TPR domain-containing protein  32.19 
 
 		 226 aa  50.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.86 
 
 		 414 aa  51.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2838  tetratricopeptide TPR_2  22.28 
 
 		 940 aa  50.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1676 aa  50.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 		 718 aa  50.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2716  hypothetical protein  20.14 
 
 		 905 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  hitchhiker  0.00105391 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 		 586 aa  50.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4749  hypothetical protein  33.79 
 
 		 136 aa  49.7  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.495876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 4079 aa  48.5  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  21.11 
 
 		 566 aa  48.1  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.79 
 
 		 574 aa  48.1  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0546  diguanylate cyclase  25.71 
 
 		 792 aa  47.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.482559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0694  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.46 
 
 		 577 aa  48.1  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  20.9 
 
 		 352 aa  47.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1138 aa  47.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1463  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 		 329 aa  47.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951693  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  20.98 
 
 		 933 aa  47.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  24.52 
 
 		 475 aa  47.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 800 aa  47.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  24.21 
 
 		 590 aa  47.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  24.21 
 
 		 575 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1217  putative fimbrial biogenesis and twitching motility protein  26.47 
 
 		 237 aa  47  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.544829  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  33.72 
 
 		 937 aa  47  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  19.96 
 
 		 573 aa  47  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0954  TPR domain-containing protein  40.58 
 
 		 579 aa  47  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.178394 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  39.51 
 
 		 489 aa  47  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  21.41 
 
 		 519 aa  46.2  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 562 aa  45.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 402 aa  45.8  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.62 
 
 		 410 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4689  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 341 aa  45.8  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 594 aa  45.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  27.95 
 
 		 694 aa  45.4  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 		 673 aa  45.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 		 3145 aa  45.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1288  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  33.93 
 
 		 262 aa  45.1  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  35.8 
 
 		 489 aa  45.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.93 
 
 		 571 aa  45.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  21.72 
 
 		 767 aa  45.1  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3717  hypothetical protein  26.17 
 
 		 559 aa  44.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.912056 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 565 aa  44.7  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.82 
 
 		 804 aa  44.3  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0570  TPR repeat-containing protein  38.57 
 
 		 591 aa  44.3  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>