More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2310 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  89.09 
 
 		 220 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 196 aa  191  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 206 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 201 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 196 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  42.45 
 
 		 209 aa  167  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 193 aa  156  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 201 aa  88.6  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  31.61 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_4794  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  27.38 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  29.11 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3566  regulatory protein TetR  27.38 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  21.47 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  26.7 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  22.95 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  26.32 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0836  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.177404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  28.65 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  28.65 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  28.27 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  22.46 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 770 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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