More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1000 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  418  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 205 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 205 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 205 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  49.48 
 
 		 204 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 204 aa  201  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 205 aa  201  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 204 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 205 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  49.01 
 
 		 204 aa  199  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  48.13 
 
 		 205 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  48.73 
 
 		 206 aa  192  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 204 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  47.42 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  50.29 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  49.43 
 
 		 204 aa  186  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 205 aa  184  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 205 aa  181  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  44.15 
 
 		 205 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  46.89 
 
 		 205 aa  177  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  47.16 
 
 		 204 aa  175  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  48.98 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6237  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250294  normal  0.446462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  27.78 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 203 aa  88.6  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 203 aa  88.2  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0612  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  27.16 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  23.84 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  31.03 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2636  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4517  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000667757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 178 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 307 aa  52  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  28.48 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  43.48 
 
 		 278 aa  51.6  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  27.15 
 
 		 265 aa  51.6  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 197 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  28.03 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  23.27 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>